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Gene

ARID2

AT-rich interaction domain 2

Sintesi

Localizzazione citogenetica
12q12
Coordinate
Cromosoma 12: 45.729.706–45.908.037 (GRCh38)
Esoni
21 esoni su 178,3 kb
Proteina
1835 amminoacidi
Noto anche come
KIAA1557, DKFZp686G052, FLJ30619, BAF200, SMARCF3, ZIPZAP, p200
Trascritto MANE Select
ENST00000334344.11NM_152641.4
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora ARID2. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di ARID2

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 12, con una parentesi dove si trova ARID2. ARID2 e 3 geni nelle vicinanze sul cromosoma 12, da 45.318.872 a 46.318.871.Cromosoma 1212q12p13.33p13.32p13.31p13.2p13.1p12.3p12.2p12.1p11.23p11.22p11.21p11.1q11q12q13.11q13.12q13.13q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.11q24.12q24.13q24.21q24.22q24.23q24.31q24.32q24.3345,4 Mb45,6 Mb45,8 Mb46 Mb46,2 MbANO6: 45.215.987–45.482.280, filamento direttoANO6ARID2: 45.729.706–45.908.037, filamento direttoARID2SCAF11: 45.919.131–45.992.120, filamento inversoSCAF11SLC38A1: 46.183.054–46.270.070, filamento inversoSLC38A1Diagramma di ARID2: 21 esoni sul filamento diretto del cromosoma 12Esone 2: 4 siti noti causativi di malattiaEsone 4: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 8: 6 siti noti causativi di malattiaEsone 9: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 10: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 11: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 12: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 14: 3 siti noti causativi di malattiaEsone 15: 36 siti noti causativi di malattiaEsone 17: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 18: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 19: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 20: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 45.729.706–45.729.928, 223 basiEsone 2: 45.730.044–45.730.137, 94 basiEsone 3: 45.731.217–45.731.314, 98 basiEsone 4: 45.811.418–45.811.551, 134 basiEsone 5: 45.817.670–45.817.888, 219 basiEsone 6: 45.821.420–45.821.487, 68 basiEsone 7: 45.836.589–45.836.655, 67 basiEsone 8: 45.836.741–45.836.991, 251 basiEsone 9: 45.837.321–45.837.417, 97 basiEsone 10: 45.837.498–45.837.707, 210 basiEsone 11: 45.839.329–45.839.496, 168 basiEsone 12: 45.846.856–45.846.937, 82 basiEsone 13: 45.848.836–45.848.970, 135 basiEsone 14: 45.849.580–45.849.776, 197 basiEsone 15: 45.850.036–45.852.896, 2861 basiEsone 16: 45.860.801–45.860.949, 149 basiEsone 17: 45.891.780–45.891.918, 139 basiEsone 18: 45.892.011–45.892.096, 86 basiEsone 19: 45.893.420–45.893.543, 124 basiEsone 20: 45.893.630–45.893.721, 92 basiEsone 21: 45.904.934–45.908.037, 3104 basi15101520215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 8,6 kb dei 178,3 kb del gene; 5508 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge ARID2

66

posizioni in ARID2 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 178,3 kb di ARID2, introni inclusi, non solo i 8,6 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene ARID2: AT-rich interaction domain 2. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/arid2

Vancouver

Dante Labs. Gene ARID2: AT-rich interaction domain 2 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/arid2

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