Gén
COQ8B
coenzyme Q8B
- HGNC 19041↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000123815↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 79934↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 19q13.2
- Koordináták
- 19. kromoszóma: 40 691 530–40 716 886 (GRCh38)
- Exonok
- 15 exon, összesen 25,4 kb
- Fehérje
- 544 aminosav
- Más néven ismert
- FLJ12229, COQ8
- Korábbi jelölések
- ADCK4
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000324464.8NM_024876.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/coq8b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a COQ8B-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Nephrotic Syndrome
- Nephrosis
Pathological processes of the KIDNEY without inflammatory or neoplastic components. Nephrosis may be a primary disorder or secondary complication of other diseases. It is characterized by the NEPHROTIC SYNDROME indicating the presence of PROTEINURIA and HYPOALBUMINEMIA with accompanying EDEMA.
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A COQ8B felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 25,4 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1635 bázis kódolja a fehérjét.
COQ8B szekvenálása
7Könnyű
Mennyire nehéz a COQ8B szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A COQ8B exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a COQ8B exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.0,9%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.32%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a COQ8B exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
20
a COQ8B génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a COQ8B mind a 25,4 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 2,4 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (20)
The COQ8B variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 8
- Patogén/valószínűleg patogén 6
- Valószínűleg patogén 6
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_024876.4(COQ8B):c.1035+2T>C (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1560G>A (p.Trp520Ter) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1468C>T (p.Arg490Cys) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1447G>T (p.Glu483Ter) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1430G>A (p.Arg477Gln) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.893+2T>A (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.532C>T (p.Arg178Trp) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1339dup (p.Glu447fs) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1297-2A>G (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.645del (p.Phe215fs) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.490G>T (p.Asp164Tyr) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.367+1G>A (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.238C>T (p.Arg80Ter) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.33del (p.Thr12fs) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.1084C>T (p.Arg362Ter) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.759C>A (p.Asn253Lys) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.449G>A (p.Arg150Gln) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.439T>C (p.Cys147Arg) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.271C>T (p.Arg91Cys) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_024876.4(COQ8B):c.49_58del (p.Gly17fs) (opens in a new tab) | nephrotic syndrome, type 9 | Valószínűleg patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACTN4actinin alpha 41 betegséget oszt meg
- ARHGDIARho GDP dissociation inhibitor alpha1 betegséget oszt meg
- COQ6coenzyme Q6, monooxygenase1 betegséget oszt meg
- DAAM2dishevelled associated activator of morphogenesis 21 betegséget oszt meg
- DGKEdiacylglycerol kinase epsilon1 betegséget oszt meg
- DLC1DLC1 Rho GTPase activating protein1 betegséget oszt meg
- EMP2epithelial membrane protein 21 betegséget oszt meg
- ITSN1intersectin 11 betegséget oszt meg
- ITSN2intersectin 21 betegséget oszt meg
- KANK2KN motif and ankyrin repeat domains 21 betegséget oszt meg
- LAMA5laminin subunit alpha 51 betegséget oszt meg
- LAMB2laminin subunit beta 21 betegséget oszt meg
A(z) COQ8B génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) COQ8B gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Optic atrophy
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
Még 18 tulajdonság megjelenítése
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Cystoid macular edema
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Decreased clarity of vision
- Photopsia
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). COQ8B gén: coenzyme Q8B. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/coq8b
Dante Labs. COQ8B gén: coenzyme Q8B [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/coq8b
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt