Gén
CTNNA1
catenin alpha 1
- HGNC 2509↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000044115↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 1495↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 5q31.2
- Koordináták
- 5. kromoszóma: 138 753 425–138 935 034 (GRCh38)
- Exonok
- 18 exon, összesen 181,6 kb
- Fehérje
- 906 aminosav
- Más néven ismert
- CAP102
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000302763.12NM_001903.5
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ctnna1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a CTNNA1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Hereditary Diffuse Gastric Cancer
- CTNNA1-related diffuse gastric and lobular breast cancer syndromeAutoszomális domináns
CTNNA1 variants that raise the risk of diffuse gastric cancer and lobular breast cancer.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Endoscopic surveillance and breast screening are usually advised.
Breast and Ovarian Cancer Genes Beyond BRCA1/2
- Hereditary breast cancerAutoszomális domináns
Inherited susceptibility to breast cancer caused by variants in one of several genes.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Earlier and more intensive breast screening, including MRI, may be recommended depending on the gene.
A CTNNA1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 181,6 kb-jából 3,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2721 bázis kódolja a fehérjét.
CTNNA1 szekvenálása
100
CTNNA1-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem olyan régióba esik, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
A teljes genomszekvenálás a CTNNA1 gén mind a 181,6 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 3,8 kb-át.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ATMATM serine/threonine kinase1 betegséget oszt meg
- BARD1BRCA1 associated RING domain 11 betegséget oszt meg
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 11 betegséget oszt meg
- CDH1cadherin 11 betegséget oszt meg
- CHEK2checkpoint kinase 21 betegséget oszt meg
- PALB2partner and localizer of BRCA21 betegséget oszt meg
A(z) CTNNA1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) CTNNA1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). CTNNA1 gén: catenin alpha 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ctnna1
Dante Labs. CTNNA1 gén: catenin alpha 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ctnna1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt