Geeni
HMGA2
high mobility group AT-hook 2
- HGNC 5009↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000149948↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 8091↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 12q14.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 12: 65 824 483–65 966 291 (GRCh38)
- Eksonit
- 5 eksonia 141,8 kb:n alueella
- Proteiini
- 109 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- BABL, LIPO
- Aiemmat symbolit
- HMGIC
- MANE Select -transkripti
- ENST00000403681.7NM_003483.6
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hmga2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue HMGA2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Imprinting-häiriöt: Prader-Willin, Silver-Russellin ja Beckwith-Wiedemannin oireyhtymät
- Silver-Russellin oireyhtymä
Kasvuhäiriö, jonka yleensä aiheuttavat metylaatiomuutokset alueella 11p15 tai kromosomin 7 äidiltä peräisin oleva uniparentaalinen disomia, ja joskus variantit geeneissä IGF2, PLAG1, HMGA2 tai CDKN1C. Se aiheuttaa kasvun rajoittumista ennen syntymää ja sen jälkeen sekä kehon epäsymmetriaa.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Diagnoosi ohjaa ravitsemuksen, verensokerin ja kasvun hoitoa.
HMGA2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 141,8 kb:stä; 330 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: HMGA2
6
HMGA2-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 141,8 kb geenistä HMGA2, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
Geeniin HMGA2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HMGA2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal scrotum morphology
- Hypospadias
- Abnormal kidney function
- Abnormal kidney location
- Cleft of scrotum
- Horseshoe kidney
- Microphallus
- Painful menstruation
Näytä 2 piirrettä lisää
Abnormality of the nervous system
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability, mild
- Specific learning disability
- Motor delay
- Tremor
- Attention deficit
- Chiari malformation
Näytä 1 piirre lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HMGA2-geeni: high mobility group AT-hook 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hmga2
Dante Labs. HMGA2-geeni: high mobility group AT-hook 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hmga2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa