Geeni
CD46
CD46 molecule
- HGNC 6953↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000117335↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 4179↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q32.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 207 752 054–207 795 504 (GRCh38)
- Eksonit
- 13 eksonia 43,5 kb:n alueella
- Proteiini
- 377 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- TRA2.10, MGC26544, TLX
- Aiemmat symbolit
- MIC10, MCP
- MANE Select -transkripti
- ENST00000367042.6NM_172351.3
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue CD46 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä, interstitiaalinen nefriitti
- Atyyppinen hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä, johon liittyy MCP/CD46-poikkeama
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Atyyppinen hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä, johon liittyy komplementtigeenin poikkeamaAutosomaalinen dominantti
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Atyyppinen hemolyyttis-ureeminen oireyhtymäAutosomaalinen dominantti
Harvinainen perinnöllinen trombottinen mikroangiopatia, joka johtuu vaihtoehtoisen komplementtireitin säätelyhäiriöstä. Sille ovat ominaisia hemolyyttisen anemian, trombosytopenian ja akuutin munuaistoiminnan häiriön muodostama kolmikko.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä
Akuutti munuaisvaurio, johon liittyy mikroangiopaattinen hemolyyttinen anemia ja trombosytopenia.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Perinnöllinen hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Perinnöllinen immuunipuutos
Yksi 114 siihen liittyvästä geenistä
Immuunijärjestelmän perinnölliset häiriöt, joita aiheuttavat yksittäisten geenien muutokset ja jotka vaikuttavat siihen, miten elimistö torjuu infektioita tai säätelee tulehdusta.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
CD46-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,3 kb geenin 43,5 kb:stä; 1 134 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä CD46
66
CD46-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Niistä 29 (44 %) osuu alueille, joita lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
- Low mappability (3 kohtaa)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (29 kohtaa)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Kokogenomi kattaa kaikki 43,5 kb geenistä CD46, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- C3complement C3Yhteisiä sairauksia: 6
- CFBcomplement factor BYhteisiä sairauksia: 6
- CFIcomplement factor IYhteisiä sairauksia: 6
- THBDthrombomodulinYhteisiä sairauksia: 6
- CFHcomplement factor HYhteisiä sairauksia: 5
- DGKEdiacylglycerol kinase epsilonYhteisiä sairauksia: 5
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseYhteisiä sairauksia: 2
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Yhteisiä sairauksia: 2
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorYhteisiä sairauksia: 2
- BCL11BBCL11 transcription factor BYhteisiä sairauksia: 2
- BLNKB cell linkerYhteisiä sairauksia: 2
- BTKBruton tyrosine kinaseYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin CD46 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CD46 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Low platelet count
- Microangiopathic hemolytic anemia
- Hemolytic anemia
- Hypofibrinogenemia
- Prolonged prothrombin time
- Decreased mean corpuscular hemoglobin concentration
- Disseminated intravascular coagulation
- Bleeding in brain
Näytä 2 piirrettä lisää
Laboratory abnormality
- High liver enzymes
- Generalized edema
- High urine protein levels
- Excess fluid in lungs
- Fluid around lungs
- Hemoglobin in urine
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Blood in urine
Näytä 2 piirrettä lisää
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CD46-geeni: CD46 molecule. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cd46
Dante Labs. CD46-geeni: CD46 molecule [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cd46
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa