Geeni
CR2
complement C3d receptor 2
- HGNC 2336↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000117322↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 1380↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 1q32.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 1: 207 454 328–207 489 892 (GRCh38)
- Eksonit
- 20 eksonia 35,6 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 092 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- CD21, C3DR
- MANE Select -transkripti
- ENST00000367057.8NM_001006658.3
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cr2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue CR2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Yleinen muuttuva immuunivajaus (monogeeninen CVID)
- Yleinen muuttuva immuunivajaus
Matala IgG sekä matala IgA ja/tai IgM ja heikko rokotevaste; yksittäisen geenin muotoihin kuuluvat NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 ja TNFRSF13B (TACI).
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Immunoglobuliinikorvaushoito ja infektioiden varhainen hoito ovat vakiohoitoja; geneettinen syy voi ohjata seurantaa autoimmuunisairauksien, lymfooman ja keuhkosairauden varalta, ja jotkin muodot (kuten LRBA-puutos) reagoivat kohdennettuun hoitoon.
Laajemmat ryhmät
Muut synnynnäiset immuunijärjestelmän häiriöt
- Perinnöllinen immuunipuutos
Yksi 114 siihen liittyvästä geenistä
Immuunijärjestelmän perinnölliset häiriöt, joita aiheuttavat yksittäisten geenien muutokset ja jotka vaikuttavat siihen, miten elimistö torjuu infektioita tai säätelee tulehdusta.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
- Immuunipuutossairaus
Yksi 170 siihen liittyvästä geenistä
Sairaus, jossa immuniteettimekanismeissa on puutetta tai vikaa, joko solullisessa tai humoraalisessa immuniteetissa.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
HSCT vakavan yhdistelmäimmuunipuutoksen (SCID) ja vakavien primaaristen immuunipuutosten hoitoon; immunoglobuliinikorvaushoito (IVIG/SCIG) vasta-ainepuutoksiin; leniolisib (Joenja, FDA 2023) APDS-oireyhtymään; geenihoito ADA-SCID-tautiin; abatasepti CTLA4- ja LRBA-puutoksiin; profylaktiset antibiootit; G-CSF krooniseen granulomatoottiseen sairauteen (CGD)
CR2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,1 kb geenin 35,6 kb:stä; 3 279 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: CR2
59
CR2-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 35,6 kb geenistä CR2, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,1 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CD19CD19 moleculeYhteisiä sairauksia: 3
- ICOSinducible T cell costimulatorYhteisiä sairauksia: 3
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Yhteisiä sairauksia: 3
- IRF2BP2interferon regulatory factor 2 binding protein 2Yhteisiä sairauksia: 3
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinYhteisiä sairauksia: 3
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Yhteisiä sairauksia: 3
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Yhteisiä sairauksia: 3
- SEC61A1SEC61 translocon subunit alpha 1Yhteisiä sairauksia: 3
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BYhteisiä sairauksia: 3
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseYhteisiä sairauksia: 2
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Yhteisiä sairauksia: 2
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorYhteisiä sairauksia: 2
Geeniin CR2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita CR2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the immune system
- Combined immunodeficiency
- Decreased circulating isohemagglutinin concentration
- Decreased circulating specific pneumococcal antibody concentration
- Partial absence of specific antibody response to unconjugated pneumococcus polysaccharide
- Recurrent bronchitis
- Antinuclear antibody positivity
- Anti-complement component C1q antibody positivity
- Anti-ribosome Po antibody positivity
Näytä 20 piirrettä lisää
- Anti-titin antibody positivity
- Antineutrophil antibody positivity
- Decreased circulating complement C3 concentration
- Decreased circulating complement C4 concentration
- Malar rash
- Anti-dsDNA antibody positivity
- Anti-La/SS-B antibody positivity
- Anti-nucleoporin 62 antibody positivity
- Anti-phosphatidic acid antibody positivity
- Anti-Ro52/TRIM21 antibody positivity
- Anti-Sm antibody positivity
- Anti-U1 ribonucleoprotein antibody positivity
- Discoid lupus rash
- Serositis
- Autoimmunity
- Meningitis
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent infections
- Recurrent pneumonia
- Recurrent respiratory infections
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). CR2-geeni: complement C3d receptor 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/cr2
Dante Labs. CR2-geeni: complement C3d receptor 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/cr2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa