Geen
TTC21B
tetratricopeptide repeat domain 21B
- HGNC 25660↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000123607↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 79809↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 2q24.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 2: 165 873 362–165 953 776 (GRCh38)
- Eksonid
- 29 eksonit, ulatus 80,4 kb
- Valk
- 1316 aminohapet
- Tuntud ka kui
- FLJ11457, JBTS11, NPHP12, IFT139B, THM1, FAP60, FLA17, IFT139, CFAP60
- MANE Select transkript
- ENST00000243344.8NM_024753.5
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ttc21b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe TTC21B ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Nefronoftiis ja Senior-Løkeni sündroom
- NefronoftiisAutosoomne retsessiivne
Retsessiivselt päriliku neerohaigus, mis on põhjustatud NPHP1 ja teiste tsiliaarsete geenide variantidest. Progresseeruv tubulointerstitsiaalne armistumine viib neerupuudulikkuseni, tavaliselt esimese kolme elukümnendi jooksul.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Haiguse teadmine võimaldab regulaarset neerufunktsiooni jälgimist, õigeaegset dialüüsi või siirdamise planeerimist ning lähisugulaste kandjatestimist.
Kuidas TTC21B on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 5,4 kb kogupikkusega 80,4 kb; neist 3951 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: TTC21B
122
TTC21B positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu TTC21B geeni 80,4 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 5,4 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- ADAMTS9ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9Jagab 1 haigust
- ANKS6ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 6Jagab 1 haigust
- CEP164centrosomal protein 164Jagab 1 haigust
- CEP83centrosomal protein 83Jagab 1 haigust
- DCDC2doublecortin domain containing 2Jagab 1 haigust
- GLIS2GLIS family zinc finger 2Jagab 1 haigust
- INVSinversinJagab 1 haigust
- MAPKBP1mitogen-activated protein kinase binding protein 1Jagab 1 haigust
- NEK8NIMA related kinase 8Jagab 1 haigust
- NPHP1nephrocystin 1Jagab 1 haigust
- NPHP3nephrocystin 3Jagab 1 haigust
- NPHP4nephrocystin 4Jagab 1 haigust
Geeniga TTC21B seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TTC21B võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Narrow chest
- Short long bone
- Abnormal shape of pelvic girdle bone
- Abnormal skeletal development
- Abnormality of the ribs
- Shorter than typical length between neck and abdomen
- Abnormal collarbone
- Abnormality of the sternum
Näita veel 2 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TTC21B geen: tetratricopeptide repeat domain 21B. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ttc21b
Dante Labs. TTC21B geen: tetratricopeptide repeat domain 21B [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ttc21b
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast