Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

KRT16

keratin 16

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
17q21.2
Koordinaadid
Kromosoom 17: 41 609 778–41 612 767 (GRCh38)
Eksonid
8 eksonit, ulatus 3 kb
Valk
473 aminohapet
Tuntud ka kui
NEPPK
MANE Select transkript
ENST00000301653.9NM_005557.4
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanne

  • Erbelised palmoplantaarsed keratodermiad ja pachyonychia congenita

    • Erbelised palmoplantaarne keratoderma

      Peopesade ja jalatallade pärilik paksenemine, sealhulgas pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima tüüpi ja Bothnia keratodermad, keratiit-ihtüoos-kurtuse sündroom ning CTSC-ga seotud Papillon-Lefèvre'i ja Haim-Munki sündroom.

      • 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
      Mida teadmine muudab

      Diagnoos suunab jalgade hooldust ja valu ravi; CTSC-ga seotud vormide puhul kaitseb varajane hambaravi hambaid ning GJB2-ga seotud vormide puhul on soovitatav kuulmise kontroll.

Kuidas KRT16 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 17, millel on sulg kohal, kus asub KRT16. KRT16 ja sellele lähedal asuvad 51 geeni kromosoomil 17, vahemikus 41 111 273 kuni 42 111 272.Kromosoom 1717q21.2p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11.1q11.2q12q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.341,2 Mb41,4 Mb41,6 Mb41,8 Mb42 MbKRTAP4-11: 41 117 181–41 118 373, pöördne ahelKRTAP4-12: 41 123 091–41 124 182, pöördne ahelKRTAP4-6: 41 139 433–41 140 544, pöördne ahelKRTAP4-5: 41 148 924–41 149 825, pöördne ahelKRTAP4-5KRTAP4-4: 41 159 649–41 160 748, pöördne ahelKRTAP4-3: 41 167 231–41 168 221, pöördne ahelKRTAP4-2: 41 177 446–41 178 221, pöördne ahelKRTAP4-2KRTAP4-1: 41 184 100–41 184 911, pöördne ahelKRTAP9-1: 41 189 887–41 190 639, otsene ahelKRTAP9-1KRTAP9-2: 41 226 648–41 227 652, otsene ahelKRTAP9-3: 41 232 449–41 233 454, otsene ahelKRTAP9-3KRTAP9-8: 41 237 999–41 239 004, otsene ahelKRTAP9-4: 41 249 687–41 250 653, otsene ahelKRTAP9-9: 41 255 384–41 256 364, otsene ahelKRTAP9-9KRTAP9-6: 41 265 378–41 265 860, otsene ahelKRTAP9-7: 41 275 698–41 276 207, otsene ahelKRTAP9-7KRTAP29-1: 41 301 826–41 302 851, pöördne ahelKRTAP16-1: 41 307 700–41 309 309, pöördne ahelKRTAP16-1KRTAP17-1: 41 314 912–41 315 710, pöördne ahelKRTAP17-1KRT33A: 41 345 665–41 350 828, pöördne ahelKRT33AKRT33B: 41 363 498–41 369 813, pöördne ahelKRT33BKRT34: 41 377 669–41 382 306, pöördne ahelKRT34KRT31: 41 393 721–41 397 611, pöördne ahelKRT31KRT37: 41 420 547–41 424 585, pöördne ahelKRT37KRT38: 41 436 154–41 440 983, pöördne ahelKRT38KRT32: 41 459 513–41 467 386, pöördne ahelKRT32KRT35: 41 476 710–41 481 151, pöördne ahelKRT36: 41 486 136–41 492 546, pöördne ahelKRT36KRT13: 41 500 981–41 505 758, pöördne ahelKRT13KRT15: 41 513 745–41 522 529, pöördne ahelKRT15KRT19: 41 523 613–41 528 370, pöördne ahelKRT19KRT9: 41 565 836–41 572 059, pöördne ahelKRT9KRT14: 41 582 279–41 586 896, pöördne ahelKRT14KRT16: 41 609 778–41 612 767, pöördne ahelKRT16KRT17: 41 619 437–41 624 842, pöördne ahelKRT17EIF1: 41 688 883–41 693 623, otsene ahelEIF1GAST: 41 710 999–41 715 973, otsene ahelGASTHAP1: 41 717 742–41 734 646, pöördne ahelHAP1JUP: 41 750 887–41 797 798, pöördne ahelJUPP3H4: 41 801 944–41 812 750, pöördne ahelP3H4FKBP10: 41 812 079–41 823 221, otsene ahelFKBP10NT5C3B: 41 823 972–41 836 271, pöördne ahelNT5C3BKLHL10: 41 835 685–41 848 384, otsene ahelKLHL10KLHL11: 41 848 513–41 865 430, pöördne ahelACLY: 41 866 916–41 930 551, pöördne ahelACLYODAD4: 41 930 599–41 966 503, otsene ahelODAD4CNP: 41 966 729–41 977 740, otsene ahelCNPDNAJC7: 41 974 005–42 021 376, pöördne ahelDNAJC7NKIRAS2: 42 011 382–42 025 644, otsene ahelNKIRAS2ZNF385C: 42 025 576–42 098 479, pöördne ahelZNF385CC17orf113: 42 038 232–42 050 601, pöördne ahelC17orf113DHX58: 42 101 404–42 112 735, pöördne ahelDHX58KRT16 skeem: 8 eksonit kromosoomi 17 pöördne ahelalEkson 6: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 7 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 8: 41 609 778–41 610 029, 252 alustEkson 7: 41 610 190–41 610 236, 47 alustEkson 6: 41 610 331–41 610 551, 221 alustEkson 5: 41 610 854–41 610 979, 126 alustEkson 4: 41 611 069–41 611 230, 162 alustEkson 3: 41 611 345–41 611 501, 157 alustEkson 2: 41 611 639–41 611 721, 83 alustEkson 1: 41 612 158–41 612 767, 610 alust876543215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 1,7 kb kogupikkusega 3 kb; neist 1422 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse KRT16

8

kohad geenis KRT16, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist 8 (100%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

  • Low mappability (6 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
  • Segmental duplications (8 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni KRT16 3 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,7 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
  • ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). KRT16 geen: keratin 16. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/krt16

Vancouver

Dante Labs. KRT16 geen: keratin 16 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/krt16

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test