Geen
KRT17
keratin 17
- HGNC 6427↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000128422↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 3872↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 17q21.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 17: 41 619 442–41 624 575 (GRCh38)
- Eksonid
- 8 eksonit, ulatus 5,1 kb
- Valk
- 432 aminohapet
- Varasemad tähised
- PCHC1
- MANE Select transkript
- ENST00000311208.13NM_000422.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe KRT17 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Erbelised palmoplantaarsed keratodermiad ja pachyonychia congenita
- Erbelised palmoplantaarne keratoderma
Peopesade ja jalatallade pärilik paksenemine, sealhulgas pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima tüüpi ja Bothnia keratodermad, keratiit-ihtüoos-kurtuse sündroom ning CTSC-ga seotud Papillon-Lefèvre'i ja Haim-Munki sündroom.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Diagnoos suunab jalgade hooldust ja valu ravi; CTSC-ga seotud vormide puhul kaitseb varajane hambaravi hambaid ning GJB2-ga seotud vormide puhul on soovitatav kuulmise kontroll.
Kuidas KRT17 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,5 kb kogupikkusega 5,1 kb; neist 1299 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse KRT17
4
kohad geenis KRT17, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 4 (100%) asuvad lõikudes, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Segmental duplications (4 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni KRT17 5,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (1,5 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- AAGABalpha and gamma adaptin binding proteinJagab 1 haigust
- AP1B1adaptor related protein complex 1 subunit beta 1Jagab 1 haigust
- AQP5aquaporin 5Jagab 1 haigust
- CTSCcathepsin CJagab 1 haigust
- DSG1desmoglein 1Jagab 1 haigust
- DSPdesmoplakinJagab 1 haigust
- GJA1gap junction protein alpha 1Jagab 1 haigust
- GJB2gap junction protein beta 2Jagab 1 haigust
- GJB3gap junction protein beta 3Jagab 1 haigust
- GJB4gap junction protein beta 4Jagab 1 haigust
- GJB6gap junction protein beta 6Jagab 1 haigust
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Jagab 1 haigust
Geeniga KRT17 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida KRT17 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). KRT17 geen: keratin 17. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/krt17
Dante Labs. KRT17 geen: keratin 17 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/krt17
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast