Gen
KRT16
keratin 16
- HGNC 6423↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000186832↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 3868↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 17q21.2
- Souřadnice
- Chromozom 17: 41 609 778–41 612 767 (GRCh38)
- Exony
- 8 exonů na 3 kb
- Protein
- 473 aminokyselin
- Další názvy
- NEPPK
- Transkript MANE Select
- ENST00000301653.9NM_005557.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si KRT16 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Hereditary Palmoplantar Keratodermas and Pachyonychia Congenita
- Hereditary palmoplantar keratoderma
Inherited thickening of the palms and soles, including pachyonychia congenita, mal de Meleda, Nagashima-type and Bothnian keratodermas, keratitis-ichthyosis-deafness syndrome, and the CTSC-related Papillon-Lefèvre and Haim-Munk syndromes.
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Diagnosis guides foot care and pain management; for CTSC-related forms early dental treatment protects the teeth, and GJB2-related forms warrant a hearing check.
Jak je KRT16 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 1,7 kb z 3 kb genu; 1 422 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte KRT16
8
pozic v genu KRT16, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 8 (100 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Low mappability (6 míst)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (8 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 3 kb genu KRT16, včetně intronů, nikoli jen 1,7 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- AAGABalpha and gamma adaptin binding proteinSdílí 1 onemocnění
- AP1B1adaptor related protein complex 1 subunit beta 1Sdílí 1 onemocnění
- AQP5aquaporin 5Sdílí 1 onemocnění
- CTSCcathepsin CSdílí 1 onemocnění
- DSG1desmoglein 1Sdílí 1 onemocnění
- DSPdesmoplakinSdílí 1 onemocnění
- GJA1gap junction protein alpha 1Sdílí 1 onemocnění
- GJB2gap junction protein beta 2Sdílí 1 onemocnění
- GJB3gap junction protein beta 3Sdílí 1 onemocnění
- GJB4gap junction protein beta 4Sdílí 1 onemocnění
- GJB6gap junction protein beta 6Sdílí 1 onemocnění
- GRHL2grainyhead like transcription factor 2Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s KRT16
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit KRT16. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the integument
- Follicular hyperkeratosis
- Poor nail formation
- Hyperkeratosis
- Overgrowth and curving of toenails
- Abnormal fingernail development
- Abnormal fingernails
- Epidermoid cyst
- Knuckle pad
Zobrazit ještě 14 rysů
- Linear arrays of macular hyperkeratoses in flexural areas
- Overgrowth and curving of fingernail
- Skin cyst
- Steatocystoma multiplex
- Thickening of upper layer of skin
- Abnormal blistering of the skin
- Eruptive vellus hair cyst
- Excessive sweating
- Hypergranulosis
- Paronychia
- Hair loss
- Chicken skin
- Perioral hyperkeratosis
- Thick nail
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen KRT16: keratin 16. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/krt16
Dante Labs. Gen KRT16: keratin 16 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/krt16
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů