Geen
HNRNPR
heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
- HGNC 5047↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000125944↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 10236↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 1p36.12
- Koordinaadid
- Kromosoom 1: 23 304 688–23 344 284 (GRCh38)
- Eksonid
- 11 eksonit, ulatus 39,6 kb
- Valk
- 633 aminohapet
- Tuntud ka kui
- hnRNP-R
- Varasemad tähised
- HNRPR
- MANE Select transkript
- ENST00000302271.11NM_005826.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe HNRNPR ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Intellektipuue
Üks 233 sellega seotud geenist
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Kuidas HNRNPR on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 7,8 kb kogupikkusega 39,6 kb; neist 1902 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse HNRNPR
1
koht geenis HNRNPR, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 1 (100%) asub lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
- Segmental duplications (1 koht)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni HNRNPR 39,6 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (7,8 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Jagab 1 haigust
- ADKadenosine kinaseJagab 1 haigust
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxJagab 1 haigust
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Jagab 1 haigust
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Jagab 1 haigust
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseJagab 1 haigust
- ANK3ankyrin 3Jagab 1 haigust
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Jagab 1 haigust
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Jagab 1 haigust
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Jagab 1 haigust
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Jagab 1 haigust
- ARID1AAT-rich interaction domain 1AJagab 1 haigust
Geeniga HNRNPR seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida HNRNPR võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of head or neck
- Broad head shape
- Development of small head that was not present at birth
- Little lower jaw
- Low hanging columella
- Short neck
- Short opening between the eyelids
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Corners of eye widely separated
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of limbs
- Curvature of little finger
- Short fingers or toes
- Short outermost little finger bone
- Broad big toe
- Broad thumb
- Curvature of 2nd toe
- Curvature of index finger
- Pes valgus
Näita veel 3 tunnust
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Attention deficit
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Epilepsy
- Repetitive movements
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Agenesis of corpus callosum
- Epileptic encephalopathy
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). HNRNPR geen: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/hnrnpr
Dante Labs. HNRNPR geen: heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/hnrnpr
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast