Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid

Geen

KDM1A

lysine demethylase 1A

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
1p36.12
Koordinaadid
Kromosoom 1: 23 019 468–23 083 689 (GRCh38)
Eksonid
21 eksonit, ulatus 64,2 kb
Valk
876 aminohapet
Tuntud ka kui
KIAA0601, BHC110, LSD1
Varasemad tähised
AOF2, KDM1
MANE Select transkript
ENST00000400181.9NM_001009999.3
Lookuse tüüp
gene with protein product
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

VõrdlusgenoomGRCh38

Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni KDM1A veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas KDM1A on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 1, millel on sulg kohal, kus asub KDM1A. KDM1A ja sellele lähedal asuvad 16 geeni kromosoomil 1, vahemikus 22 551 579 kuni 23 551 578.Kromosoom 11p36.12p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q4422,6 Mb22,8 Mb23 Mb23,2 Mb23,4 MbEPHA8: 22 563 461–22 603 595, otsene ahelEPHA8C1QA: 22 635 057–22 640 201, otsene ahelC1QA: 22 636 506–22 644 067, otsene ahelC1QC: 22 642 558–22 648 122, otsene ahelC1QCC1QB: 22 652 713–22 661 637, otsene ahelC1QBEPHB2: 22 710 798–22 921 500, otsene ahelEPHB2LACTBL1: 22 953 043–22 972 866, pöördne ahelLACTBL1TEX46: 23 010 833–23 019 100, pöördne ahelTEX46KDM1A: 23 019 468–23 083 689, otsene ahelKDM1ALUZP1: 23 084 030–23 178 152, pöördne ahelLUZP1: 23 094 326–23 094 376, pöördne ahelHTR1D: 23 190 178–23 217 547, pöördne ahelHTR1DHNRNPR: 23 303 771–23 344 658, pöördne ahelHNRNPRZNF436: 23 359 448–23 369 960, pöördne ahelZNF436TCEA3: 23 370 591–23 425 169, pöördne ahelTCEA3ASAP3: 23 428 560–23 484 637, pöördne ahelASAP3E2F2: 23 506 423–23 531 241, pöördne ahelE2F2KDM1A skeem: 21 eksonit kromosoomi 1 otsene ahelalEkson 3: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 11: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 15: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 16: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 20: 1 teadaolev haigust põhjustav kohtEkson 1: 23 019 468–23 019 947, 480 alustEkson 2: 23 030 469–23 030 634, 166 alustEkson 3: 23 044 427–23 044 486, 60 alustEkson 4: 23 050 387–23 050 520, 134 alustEkson 5: 23 053 761–23 053 839, 79 alustEkson 6: 23 055 069–23 055 161, 93 alustEkson 7: 23 055 932–23 056 038, 107 alustEkson 8: 23 057 484–23 057 565, 82 alustEkson 9: 23 059 073–23 059 167, 95 alustEkson 10: 23 066 060–23 066 071, 12 alustEkson 11: 23 068 539–23 068 681, 143 alustEkson 12: 23 069 061–23 069 151, 91 alustEkson 13: 23 071 225–23 071 359, 135 alustEkson 14: 23 072 124–23 072 197, 74 alustEkson 15: 23 073 292–23 073 403, 112 alustEkson 16: 23 077 228–23 077 360, 133 alustEkson 17: 23 078 990–23 079 177, 188 alustEkson 18: 23 079 553–23 079 667, 115 alustEkson 19: 23 081 446–23 081 573, 128 alustEkson 20: 23 082 220–23 082 366, 147 alustEkson 21: 23 083 179–23 083 689, 511 alust1215′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 3,1 kb kogupikkusega 64,2 kb; neist 2631 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse KDM1A

5

kohad geenis KDM1A, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni KDM1A 64,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,1 kb).

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). KDM1A geen: lysine demethylase 1A. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/kdm1a

Vancouver

Dante Labs. KDM1A geen: lysine demethylase 1A [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/kdm1a

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test