Gen
MYD88
MYD88 innate immune signal transduction adaptor
- HGNC 7562↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000172936↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 4615↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 3p22.2
- Koordinatlar
- Kromozom 3: 38.138.661–38.143.022 (GRCh38)
- Eksonlar
- 4,4 kb boyunca 5 ekson
- Protein
- 296 amino asit, 33,2 kDa
- MANE Select transkripti
- ENST00000650905.2NM_002468.5
- Lokus türü
- Protein kodlayan
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Share this page
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/myd88.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameMYD88 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Diğer Doğuştan İmmün Yetmezlikler
- İmmün Yetmezlik Hastalığı
Buna bağlı 170 gen arasından biri
Hücresel veya humoral bağışıklık mekanizmalarında eksiklik ya da bozukluk bulunan hastalık.
- 2 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Ağır kombine immün yetmezlik (SCID) ve ağır primer immün yetmezlikler için HSCT; antikor eksikliklerinde immünoglobulin replasmanı (IVIG/SCIG); APDS için lenyolisib (Joenja, FDA 2023); ADA-SCID için gen tedavisi; CTLA4/LRBA eksikliği için abatasept; profilaktik antibiyotikler; KGH için G-CSF
MYD88 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 4,4 kb uzunluğunun 2,7 kb'sini oluşturur; bu bazların 891 tanesi proteini kodlar.
MYD88 Dizilemesi
4Kolay
MYD88 geninin kısa okumalarla dizilenmesinin ne kadar zor olduğu, 100 üzerinden
0 · Kolay100 · Zor
MYD88 geninin ekzonlarının neredeyse tamamı, kısa okumaların temiz biçimde eşleştiği yerlerde bulunuyor.
Buna eklenen etken: MYD88 geninin ekzonlarının her bir zor bölge türündeki payı
- Eşlenebilirlik100 veya 250 bp'lik okumaların tek bir yere yerleştirilemediği bölgeler; bu bölgelerdeki bir çağrı eksik veya yanlış olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 100 puan alırdı.%0
- HomolojiGenomun başka yerlerindeki, paralog ve psödogenler gibi, %90 veya daha yüksek özdeşlikle kopyalanmış segmental duplikasyonlar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- chrY ile ortak bölgelerchrX ve chrY'nin aynı veya neredeyse aynı diziyi taşıdığı pseudoautosomal bölgeler ve X'e transpoze olmuş bölge; bu nedenle bir chrX okuması chrY'ye yerleştirilmiş olabilir. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 60 puan alırdı.%0
- Referans kapsamıYakınlardaki referans birleştirmesindeki boşluklar; okumaların hizalanacağı bir dizinin bulunmadığı yerler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 50 puan alırdı.%0
- TekrarlarOkumaların kaydığı ve tamamını kapsayamayabildiği ardışık tekrarlar ve tek bazın tekrarladığı diziler. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 30 puan alırdı.%4,2
- GC içeriğiG ve C oranı %25'in altında veya %65'in üzerinde olan pencereler; kütüphane hazırlığı bu pencereleri seyrek kapsar. Tek başına, tamamı bu türde bir bölgede bulunan bir gen 20 puan alırdı.%14
Dante Labs'in, NIST'in zor dizilenen bölgelerin Genome in a Bottle haritaları üzerine kurulu kendi araştırmasından elde edilen bir Dante Labs puanı.Puanın hesaplanma biçimiHer çubuk, MYD88 geninin ekzon bazlarının o zor bölge türündeki payını gösterir. Her tür tek başına bir geni zor hale getirebilir ve her ek tür daha az katkı yapar: hiçbir bazın hiçbirinde yer almadığı durumda 0, her bazın tek bir yere yerleştirilemediği bölgede olduğu durumda 100.
6
ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı MYD88 içindeki konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom dizilemesi, intronlar dahil olmak üzere MYD88 geninin tamamını, yani 4,4 kb'ın tamamını kapsar; yalnızca 2,7 kb'lık ekzonları değil.
ClinVar patojenik varyantlar (6)
ClinVar'ın MYD88 geninde patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı, herhangi bir hastalıkla ilişkili ve en az bir gönderen tarafından kriterlere göre incelenmiş varyantlar ile bunların arasında en çok incelenenler. Bu, ClinVar'ın genin herkese açık kaydıdır, hiçbir zaman bir test sonucu değildir.
- Patojenik 2
- Patojenik/muhtemelen patojenik 2
- Muhtemelen patojenik 2
| Varyant | Hastalıklar | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|
| NM_002468.5(MYD88):c.103_104del (p.Leu35fs) | pyogenic bacterial infections due to MyD88 deficiency | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_002468.5(MYD88):c.154GAG[1] (p.Glu53del) | pyogenic bacterial infections due to MyD88 deficiency | Patojenik/muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 2 yıldız Kriter belirtilmiş, birden fazla bildiren, çelişki yok |
| NM_002468.5(MYD88):c.157G>T (p.Glu53Ter) | pyogenic bacterial infections due to MyD88 deficiency | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_002468.5(MYD88):c.256_257del (p.Val86fs) | pyogenic bacterial infections due to MyD88 deficiency | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_002468.5(MYD88):c.463+1G>A | pyogenic bacterial infections due to MyD88 deficiency | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
| NM_002468.5(MYD88):c.562C>T (p.Arg188Ter) | pyogenic bacterial infections due to MyD88 deficiency | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 1 yıldız Kriter belirtilmiş, tek bildiren |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- ADAadenosine deaminase1 durumu paylaşıyor
- AICDAactivation induced cytidine deaminase1 durumu paylaşıyor
- AK2adenylate kinase 21 durumu paylaşıyor
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1B1 durumu paylaşıyor
- ARPC5actin related protein 2/3 complex subunit 51 durumu paylaşıyor
- ATMATM serine/threonine kinase1 durumu paylaşıyor
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 11 durumu paylaşıyor
- B2Mbeta-2-microglobulin1 durumu paylaşıyor
- BACH2BACH transcriptional regulator 21 durumu paylaşıyor
- BCL10BCL10 immune signaling adaptor1 durumu paylaşıyor
- BCL11BBCL11 transcription factor B1 durumu paylaşıyor
- BLNKB cell linker1 durumu paylaşıyor
MYD88 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, MYD88 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Blood cancer
- Cancer of lymphatic system
- Low blood neutrophil count
- Abnormality of neutrophils
- Bleeding gums
- Hypercoagulability
- Normocytic anemia
- Blood spots
4 özellik daha göster
Abnormality of the immune system
- Decreased immune function
- Recurrent bacterial infections
- Recurrent staphylococcal infections
- Recurrent streptococcus pneumoniae infections
- Abscess
- Recurrent bacterial skin infections
- Recurrent meningitis
- Cryoglobulinemia
3 özellik daha göster
Abnormality of the cardiovascular system
- Abnormality of retina blood vessels
- Cardiac failure
- Cutis marmorata
- Hives
- Increased spleen size
- Inflammation of blood vessel
- Stroke
- Swollen lymph nodes
1 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'den MANE Select v1.5: transkript, ekson ve kodlayan dizi.
- 2026-10-21 tarihli GenCC ve ClinGen: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı alanlar.
- NIST'ten Genome in a Bottle genom tabakalandırmaları: dizileme zorluk puanı.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.21-777c9289.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). MYD88 geni: MYD88 innate immune signal transduction adaptor. Erişim tarihi: 21 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/myd88
Dante Labs. MYD88 geni: MYD88 innate immune signal transduction adaptor [Internet]. [alıntı tarihi 21 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/myd88
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde