Gen
SZT2
SZT2 subunit of KICSTOR complex
- HGNC 29040↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000198198↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 23334↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 1p34.2
- Współrzędne
- Chromosom 1: 43 389 899–43 454 247 (GRCh38)
- Eksony
- 72 eksonów na odcinku 64,3 kb
- Białko
- 3432 aminokwasów
- Znany również jako
- FLJ10387, SZT2B, RP11-506B15.1, FLJ34502, SZT2A, KICS1
- Poprzednie symbole
- C1orf84, KIAA0467
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000634258.3NM_001365999.1
- Typ locus
- gene with protein product
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SZT2 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 6 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu SZT2
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 14,1 kb z 64,3 kb genu; 10 299 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SZT2
37
pozycje w SZT2, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 64,3 kb genu SZT2, łącznie z intronami, a nie tylko 14,1 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SZT2
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SZT2. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Profound global developmental delay
- Encephalopathy
- Abnormality of coordination
- Absent speech development
- Atypical absence seizure
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
Pokaż jeszcze 31 cech
- EEG with multifocal slow activity
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Tonic seizure
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Tremor
- Unsteady walk
- Repeated seizures without recovery between them
- Brief seizures with staring spells
- EEG abnormality
- Epileptic encephalopathy
- Generalized-onset seizure
- Seizure affecting one half of brain
- Thick corpus callosum
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SZT2: SZT2 subunit of KICSTOR complex. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/szt2
Dante Labs. Gen SZT2: SZT2 subunit of KICSTOR complex [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/szt2
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni