Gen
SLC34A1
solute carrier family 34 member 1
- HGNC 11019↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000131183↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6569↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 5q35.3
- Współrzędne
- Chromosom 5: 177 384 434–177 398 848 (GRCh38)
- Eksony
- 13 eksonów na odcinku 14,4 kb
- Białko
- 639 aminokwasów
- Znany również jako
- NAPI-3, NPTIIa, SLC11
- Poprzednie symbole
- NPT2, SLC17A2
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000324417.6NM_003052.5
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc34a1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj SLC34A1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Hiperkalcemia niemowlęca
- Autosomalne recesywne
Choroba z hiperkalcemią, która występuje między 28. dniem a pierwszym rokiem życia.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu SLC34A1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,6 kb z 14,4 kb genu; 1920 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie SLC34A1
39
pozycje w SLC34A1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 14,4 kb genu SLC34A1, łącznie z intronami, a nie tylko 2,6 kb eksonów.
ClinVar pathogenic variants (40)
The SLC34A1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenny 8
- Patogenny/prawdopodobnie patogenny 6
- Prawdopodobnie patogenny 26
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_003052.5(SLC34A1):c.241dup (p.Glu81fs) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.644+1G>A (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.73C>T (p.Arg25Ter) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.244G>T (p.Glu82Ter) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.454_480dup (p.Val152_Val160dup) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.458G>T (p.Gly153Val) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.1006+1G>A (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 1 other | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.1223T>A (p.Val408Glu) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny/prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.460_480dup (p.Ile154_Val160dup) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.937-2A>C (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 1 other | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.1484G>A (p.Arg495His) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.1614G>A (p.Trp538Ter) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★2 gwiazdek z 4 podano kryteria, wielu zgłaszających, bez konfliktów |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.189del (p.Cys64fs) (opens in a new tab) | hypercalcemia, infantile, 2 and 1 other | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.557_558del (p.Pro186fs) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.627del (p.Asp209fs) (opens in a new tab) | hypercalcemia, infantile, 2 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.644+2T>G (opens in a new tab) | hypophosphatemic nephrolithiasis/osteoporosis 1 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.934C>T (p.Gln312Ter) (opens in a new tab) | hypophosphatemic nephrolithiasis/osteoporosis 1 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.1188del (p.Phe397fs) (opens in a new tab) | hypercalcemia, infantile, 2 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.189_190del (p.Cys64fs) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.247G>T (p.Glu83Ter) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 2 others | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.527_528del (p.Ser176fs) (opens in a new tab) | hypercalcemia, infantile, 2 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.580G>C (p.Gly194Arg) (opens in a new tab) | hypercalcemia, infantile, 2 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.581G>A (p.Gly194Asp) (opens in a new tab) | hypercalcemia, infantile, 2 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.644G>A (p.Arg215Gln) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 and 1 other | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_003052.5(SLC34A1):c.690dup (p.Val231fs) (opens in a new tab) | Fanconi renotubular syndrome 2 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
See all 40 with every other SLC34A1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
Cechy powiązane z genem SLC34A1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SLC34A1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Laboratory abnormality
- Elevated circulating calcitriol concentration
- Elevated urine calcium levels
- Generalized aminoaciduria
- Glucose in urine
- High urine protein levels
- Low blood phosphate level
- Renal phosphate wasting
- Abnormal urine pH
Pokaż jeszcze 17 cech
- Bicarbonate-wasting renal tubular acidosis
- Bicarbonaturia
- Decreased circulating parathyroid hormone level
- Elevated alkaline phosphatase of bone origin
- Elevated circulating beta-CTX concentration
- High urine phosphate levels
- High urine uric acid level
- Hyperchloremic metabolic acidosis
- Low-molecular-weight proteinuria
- Proximal renal tubular acidosis
- Increased urinary potassium
- Low blood potassium levels
- Low blood uric acid levels
- Renal sodium wasting
- Dehydration
- Low blood sugar
- High blood calcium levels
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-18: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-8b139e39.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC34A1: solute carrier family 34 member 1. Pobrano 19 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/slc34a1
Dante Labs. Gen SLC34A1: solute carrier family 34 member 1 [Internet]. [cytowano 19 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/slc34a1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni