Gen
SLC39A8
solute carrier family 39 member 8
- HGNC 20862↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000138821↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 64116↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 4q24
- Coördinaten
- Chromosoom 4: 102.261.666–102.345.482 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons over 83,8 kb
- Eiwit
- 460 aminozuren
- Ook bekend als
- BIGM103, ZIP8, ZIP-8
- MANE Select-transcript
- ENST00000356736.5NM_001135146.2
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc39a8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees SLC39A8 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Congenitale glycosylatiestoornissen
- SLC39A8-CDGAutosomaal recessief
Een congenitale glycosylatiestoornis veroorzaakt door varianten in het mangaantransportergen SLC39A8, met ontwikkelingsachterstand, lage spierspanning, epileptische aanvallen en een zeer laag mangaangehalte in het bloed.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Mangaan in hoge dosis, met of zonder galactose, onder specialistisch toezicht kan de glycosylatie verbeteren.
- Congenitale glycosylatiestoornissen (CDG)
Een van 98 genen die hiermee verband houden
Een grote groep erfelijke aandoeningen waarbij suikerketens (glycanen) niet correct worden opgebouwd of aan eiwitten en lipiden worden gehecht, wat vaak gevolgen heeft voor de hersenen, de lever, de bloedstolling, de groei en veel andere lichaamssystemen. De meeste zijn autosomaal recessief, maar sommige zijn X-gebonden of autosomaal dominant.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van SLC39A8
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,2 kb van de 83,8 kb van het gen; 1.383 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van SLC39A8
7
posities in SLC39A8 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 83,8 kb van SLC39A8, inclusief intronen, en niet alleen de 3,2 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Deelt 1 aandoening
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeelt 1 aandoening
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeelt 1 aandoening
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan SLC39A8
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die SLC39A8 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). SLC39A8-gen: solute carrier family 39 member 8. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/slc39a8
Dante Labs. SLC39A8-gen: solute carrier family 39 member 8 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/slc39a8
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken