Genas
B4GALNT1
beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1
- HGNC 4117↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000135454↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 2583↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 12q13.3
- Koordinatės
- Chromosoma 12: 57 623 409–57 633 201 (GRCh38)
- Eksonai
- 11 eksonų per 9,8 kb
- Baltymas
- 533 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- beta1-4GalNAc-T
- Ankstesni simboliai
- GALGT, SPG26
- MANE Select transkriptas
- ENST00000341156.9NM_001478.5
- Lokuso tipas
- Protein-coding
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/b4galnt1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite B4GALNT1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Paveldima spastinė paraplegija
- Paveldimos spastinės paraplegijos (visi tipai)
Vienas iš 66 su juo susijusių genų
Bendras terminas, apimantis visas paveldimas spastines paraplegijas, įskaitant SPG4 (SPAST) – dažniausią dominuojančią formą – taip pat SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ir SPG31.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas B4GALNT1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 5,4 kb iš 9,8 kb geno; 1 602 šių bazių koduoja baltymą.
Sekvenavimas: B4GALNT1
15
vietos geno B4GALNT1 sekoje, kuriose ClinVar pakitimus klasifikuoja kaip patogeninius arba tikriausiai patogeninius
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurioje trumpais skaitiniais sunku nustatyti.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 9,8 kb geno B4GALNT1, įskaitant intronus, o ne tik 5,4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Turi 1 bendrą būklę
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseTuri 1 bendrą būklę
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Turi 1 bendrą būklę
- AMFRautocrine motility factor receptorTuri 1 bendrą būklę
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Turi 1 bendrą būklę
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Turi 1 bendrą būklę
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Turi 1 bendrą būklę
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Turi 1 bendrą būklę
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Turi 1 bendrą būklę
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Turi 1 bendrą būklę
- ATL1atlastin GTPase 1Turi 1 bendrą būklę
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su B4GALNT1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti B4GALNT1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability, mild
- Babinski sign
- Abnormal gait
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty articulating speech
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Impaired vibratory sensation
- Increased reflexes
Rodyti dar 11 savybių
Abnormality of the musculoskeletal system
- Lower limb spasticity
- Distal lower limb amyotrophy
- Muscle degeneration
- Muscle weakness
- Scoliosis
- Uncontrollable movement in upper arms
- Frequent falls
- Spastic paraplegia
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). B4GALNT1 genas: beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/b4galnt1
Dante Labs. B4GALNT1 genas: beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/b4galnt1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites