Gene
B4GALNT1
beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1
- HGNC 4117↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000135454↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 2583↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 12q13.3
- Coordinate
- Cromosoma 12: 57.623.409–57.633.201 (GRCh38)
- Esoni
- 11 esoni su 9,8 kb
- Proteina
- 533 amminoacidi
- Noto anche come
- beta1-4GalNAc-T
- Simboli precedenti
- GALGT, SPG26
- Trascritto MANE Select
- ENST00000341156.9NM_001478.5
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Paraplegia spastica ereditaria
- Paraplegia spastica ereditaria (tutti i tipi)
Uno di 66 geni collegati ad esso
Termine generale che comprende tutte le paraplegie spastiche ereditarie, tra cui SPG4 (SPAST), la forma dominante più comune, e SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 e SPG31.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di B4GALNT1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 5,4 kb dei 9,8 kb del gene; 1602 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge B4GALNT1
15
posizioni in B4GALNT1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 9,8 kb di B4GALNT1, introni inclusi, non solo i 5,4 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Condivide 1 condizione
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseCondivide 1 condizione
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Condivide 1 condizione
- AMFRautocrine motility factor receptorCondivide 1 condizione
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Condivide 1 condizione
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Condivide 1 condizione
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Condivide 1 condizione
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Condivide 1 condizione
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Condivide 1 condizione
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Condivide 1 condizione
- ATL1atlastin GTPase 1Condivide 1 condizione
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Condivide 1 condizione
Tratti collegati a B4GALNT1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che B4GALNT1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Intellectual disability, mild
- Babinski sign
- Abnormal gait
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Difficulty articulating speech
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Impaired vibratory sensation
- Increased reflexes
Mostra altri 11 tratti
Abnormality of the musculoskeletal system
- Lower limb spasticity
- Distal lower limb amyotrophy
- Muscle degeneration
- Muscle weakness
- Scoliosis
- Uncontrollable movement in upper arms
- Frequent falls
- Spastic paraplegia
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene B4GALNT1: beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/b4galnt1
Dante Labs. Gene B4GALNT1: beta-1,4-N-acetyl-galactosaminyltransferase 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/b4galnt1
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