Gene
PKD1
polycystin 1, transient receptor potential channel interacting
- HGNC 9008↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000008710↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 5310↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 16p13.3
- Coordinate
- Cromosoma 16: 2.088.708–2.135.898 (GRCh38)
- Esoni
- 46 esoni su 47,2 kb
- Proteina
- 4303 amminoacidi
- Noto anche come
- PBP, Pc-1, TRPP1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000262304.9NM_001009944.3
- Tipo di locus
- Protein-coding
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Rene policistico
Una patologia genetica solitamente a trasmissione autosomica dominante e, meno frequentemente, autosomica recessiva, caratterizzata dalla formazione di numerose cisti renali che possono condurre all'insufficienza renale terminale. La forma autosomica dominante è associata ad alterazioni sul braccio corto del cromosoma 16; i sintomi si manifestano solitamente in età adulta e comprendono dolore addominale, ematuria e ipertensione arteriosa. I pazienti possono inoltre sviluppare aneurismi cerebrali e cisti epatiche. La forma autosomica recessiva si manifesta invece precocemente con insufficienza renale progressiva e sintomi correlati alla fibrosi epatica, ed è associata ad anomalie del cromosoma 6. Il rene policistico può anche manifestarsi come conseguenza secondaria nei pazienti sottoposti a dialisi a lungo termine.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 5 submitter GenCC lo valutano come definitivo o forte
▶Azionabilità
Tolvaptan (Jynarque, approvato da FDA nel 2018) per l'ADPKD a rapida progressione; controllo della pressione arteriosa (target <110/75); gestione del dolore; trattamento delle infezioni delle cisti; screening degli aneurismi intracranici mediante angio-RM cerebrale; trapianto renale in caso di insufficienza renale terminale (ESRD)
Struttura di PKD1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 14,1 kb dei 47,2 kb del gene; 12.912 di queste basi codificano la proteina.
Sequenziamento di PKD1
1583
posizioni in PKD1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
1217 di queste (77%) ricadono in regioni che le letture corte faticano a leggere.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (1082 siti)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (1217 siti)
Un genoma intero copre tutti i 47,2 kb di PKD1, introni compresi, non solo i 14,1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseCondivide 1 condizione
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseCondivide 1 condizione
- DNAJB11DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11Condivide 1 condizione
- DZIP1LDAZ interacting zinc finger protein 1 likeCondivide 1 condizione
- GANABglucosidase II alpha subunitCondivide 1 condizione
- IFT140intraflagellar transport 140Condivide 1 condizione
- NEK8NIMA related kinase 8Condivide 1 condizione
- PKD2polycystin 2, transient receptor potential cation channelCondivide 1 condizione
- PKHD1PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductinCondivide 1 condizione
Tratti collegati a PKD1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PKD1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the genitourinary system
- Cystic kidney disease
- Decreased glomerular filtration rate
- Renal failure
- Chronic kidney disease
- Stage 5 chronic kidney disease
- Calcium oxalate nephrolithiasis
- Enlarged kidney
- Frequent urinary tract infections
Mostra altri 4 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-17: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.17-8666dff2.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PKD1: polycystin 1, transient receptor potential channel interacting. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pkd1
Dante Labs. Gene PKD1: polycystin 1, transient receptor potential channel interacting [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pkd1
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