Genas
PKD1
polycystin 1, transient receptor potential channel interacting
- HGNC 9008↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000008710↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 5310↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 16p13.3
- Koordinatės
- Chromosoma 16: 2 088 708–2 135 898 (GRCh38)
- Eksonai
- 46 eksonų per 47,2 kb
- Baltymas
- 4 303 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- PBP, Pc-1, TRPP1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000262304.9NM_001009944.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite PKD1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Policistinė inkstų liga
Dažniausiai autosominis dominantinis, rečiau autosominis recesyvinis genetinis sutrikimas, kuriam būdingos daugybė inkstų cistų, vedančių į galutinio stadijos inkstų nepakankamumą. Autosominį dominantinį tipą sieja 16-osios chromosomos trumpojo peties pakitimai. Autosominio dominantinio tipo ligoniams simptomai dažniausiai atsiranda vidutiniame amžiuje ir apima pilvo skausmus, hematuriją ir aukštą kraujospūdį. Ligoniams gali išsivystyti smegenų aneurizmos ir kepenų cistos. Autosominio recesyvinio tipo ligoniams anksti gyvenime išsivysto progresuojantis inkstų nepakankamumas ir simptomai, atsirandantys dėl kepenų fibrozės. Autosominį recesyvinį tipą sieja 6-osios chromosomos pakitimai. Policistinė inkstų liga gali atsirasti ir kaip šalutinis poveikis ligoniams, gydomiems inkstų dialize.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Tolvaptanas (Jynarque, FDA 2018) sparčiai progresuojančiai ADPKD; kraujospūdžio kontrolė (tikslas <110/75); skausmo valdymas; cistų infekcijos gydymas; smegenų MRA tyrimas intrakranijinėms aneurizmoms išsiaiškinti; inkstų transplantacija ESRD atveju
Kaip išdėstytas PKD1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 14,1 kb iš 47,2 kb geno; 12 912 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito PKD1
1 583
PKD1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Iš jų 1 217 (77 %) patenka į sritis, kurias trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
- Low mappability (1 082 vietų)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (1 217 vietų)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 47,2 kb PKD1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 14,1 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- DNAJB11DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11Turi 1 bendrą būklę
- DZIP1LDAZ interacting zinc finger protein 1 likeTuri 1 bendrą būklę
- GANABglucosidase II alpha subunitTuri 1 bendrą būklę
- IFT140intraflagellar transport 140Turi 1 bendrą būklę
- NEK8NIMA related kinase 8Turi 1 bendrą būklę
- PKD2polycystin 2, transient receptor potential cation channelTuri 1 bendrą būklę
- PKHD1PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductinTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su PKD1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti PKD1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the genitourinary system
- Cystic kidney disease
- Decreased glomerular filtration rate
- Renal failure
- Chronic kidney disease
- Stage 5 chronic kidney disease
- Calcium oxalate nephrolithiasis
- Enlarged kidney
- Frequent urinary tract infections
Rodyti dar 4 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). PKD1 genas: polycystin 1, transient receptor potential channel interacting. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/pkd1
Dante Labs. PKD1 genas: polycystin 1, transient receptor potential channel interacting [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/pkd1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites