Gen
PKD1
polycystin 1, transient receptor potential channel interacting
- HGNC 9008↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000008710↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 5310↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 16p13.3
- Koordinater
- Kromosom 16: 2.088.708–2.135.898 (GRCh38)
- Exoner
- 46 exoner fordelt over 47,2 kb
- Protein
- 4.303 aminosyrer
- Også kendt som
- PBP, Pc-1, TRPP1
- MANE Select-transkript
- ENST00000262304.9NM_001009944.3
- Lokustype
- Protein-coding
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pkd1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs PKD1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Polycystisk nyresygdom
En genetisk sygdom, der oftest nedarves autosomalt dominant og sjældnere autosomalt recessivt, og som er kendetegnet ved tilstedeværelsen af talrige cyster i nyrerne, der fører til terminal nyresvigt. Den autosomal dominante form er forbundet med afvigelser på det korte arm af kromosom 16. Symptomer hos patienter med den autosomal dominante form opstår typisk i middelalderen og omfatter mavesmerter, blod i urinen og højt blodtryk. Patienter kan udvikle aneurismer i hjernen og cyster i leveren. Patienter med den autosomal recessive form får tidligt i livet progressiv nyresvigt og symptomer som følge af leverfibrose. Den autosomal recessive form er forbundet med afvigelser på kromosom 6. Polycystisk nyresygdom kan også opstå som bivirkning hos patienter i nyredialyse.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitiv
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Tolvaptan (Jynarque, FDA 2018) ved hurtigt progredierende ADPKD; blodtryksregulering (mål <110/75); smertebehandling; behandling af cysteinfektion; screening med hjerne-MRA for intrakranielle aneurismer; nyretransplantation ved ESRD
Sådan er PKD1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 14,1 kb af genets 47,2 kb; 12.912 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af PKD1
1.583
positioner i PKD1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
1.217 af dem (77 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved at dække.
- Low mappability (1.082 positioner)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (1.217 positioner)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
En helgenomsanalyse dækker alle 47,2 kb af PKD1, inklusive introner, og ikke kun de 14,1 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ALG5ALG5 dolichyl-phosphate beta-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseDeler 1 sygdom
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseDeler 1 sygdom
- DNAJB11DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B11Deler 1 sygdom
- DZIP1LDAZ interacting zinc finger protein 1 likeDeler 1 sygdom
- GANABglucosidase II alpha subunitDeler 1 sygdom
- IFT140intraflagellar transport 140Deler 1 sygdom
- NEK8NIMA related kinase 8Deler 1 sygdom
- PKD2polycystin 2, transient receptor potential cation channelDeler 1 sygdom
- PKHD1PKHD1 ciliary IPT domain containing fibrocystin/polyductinDeler 1 sygdom
Træk knyttet til PKD1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, PKD1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). PKD1-genet: polycystin 1, transient receptor potential channel interacting. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/pkd1
Dante Labs. PKD1-genet: polycystin 1, transient receptor potential channel interacting [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/pkd1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger