Gene
PDX1
pancreatic and duodenal homeobox 1
- HGNC 6107↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000139515↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 3651↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 13q12.2
- Coordinate
- Cromosoma 13: 27.920.000–27.926.313 (GRCh38)
- Esoni
- 2 esoni su 6,3 kb
- Proteina
- 283 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Noto anche come
- IDX-1, STF-1, PDX-1, MODY4, GSF, IUF-1
- Simboli precedenti
- IPF1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000381033.5NM_000209.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Diabete mellito
Un disturbo metabolico caratterizzato da livelli anormalmente elevati di glucosio nel sangue dovuti a una ridotta produzione di insulina o a insulino-resistenza/desensibilizzazione.
- ClinGen valuta il legame come moderato
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Teplizumab (Tzield) per il T1D presintomatico di stadio 2 (approvato dalla FDA nel 2022); terapia insulinica sostitutiva all'esordio clinico del T1D; screening degli autoanticorpi TrialNet per i familiari ad alto rischio; sistemi di somministrazione dell'insulina a circuito chiuso
Maturity-Onset Diabetes Of The Young
- Autosomica dominante
Il MODY (diabete ad esordio giovanile della maturità, maturity-onset diabetes of the young) è una forma rara, familiare, clinicamente e geneticamente eterogenea di diabete, caratterizzata da un esordio in giovane età (generalmente tra i 10 e i 45 anni) con conservazione della produzione endogena di insulina, assenza di autoimmunità delle cellule beta pancreatiche, assenza di obesità e di insulino-resistenza e, in alcuni sottotipi, manifestazioni extrapancreatiche.
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
GCK-MODY: nessun trattamento necessario; HNF1A/HNF4A-MODY: sulfoniluree a basso dosaggio; HNF1B-MODY: insulina + monitoraggio renale; T2D poligenico: modifiche dello stile di vita, metformina, agonisti del recettore GLP-1, inibitori SGLT2 in base al profilo di comorbilità
Diabete mellito neonatale
Diabete diagnosticato nei primi mesi di vita, permanente o transitorio, causato da difetti a singolo gene nella produzione o nella secrezione di insulina.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
La maggior parte delle persone con diabete neonatale dovuto a KCNJ11 o ABCC8 può passare dalle iniezioni di insulina alle compresse di sulfonilurea, spesso con un migliore controllo della glicemia.
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
Struttura di PDX1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,6 kb dei 6,3 kb del gene; 852 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge PDX1
10
posizioni in PDX1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 6,3 kb di PDX1, introni inclusi, non solo i 2,6 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Condivide 3 condizioni
- GCKglucokinaseCondivide 3 condizioni
- HNF1BHNF1 homeobox BCondivide 3 condizioni
- INSinsulinCondivide 3 condizioni
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Condivide 3 condizioni
- NEUROD1neuronal differentiation 1Condivide 3 condizioni
- APPL1adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1Condivide 2 condizioni
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinCondivide 2 condizioni
- CELcarboxyl ester lipaseCondivide 2 condizioni
- EIF2B1eukaryotic translation initiation factor 2B subunit alphaCondivide 2 condizioni
- GATA4GATA binding protein 4Condivide 2 condizioni
- GATA6GATA binding protein 6Condivide 2 condizioni
Tratti collegati a PDX1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PDX1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Generalized myoclonic seizure
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Intellectual disability
- Motor delay
- Neurodevelopmental delay
- Apraxia
- Ataxia
Mostra altri 3 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PDX1: pancreatic and duodenal homeobox 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/pdx1
Dante Labs. Gene PDX1: pancreatic and duodenal homeobox 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/pdx1
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