Gén
PARS2
prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial
- HGNC 30563↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000162396↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 25973↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1p32.3
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 54 756 898–54 764 523 (GRCh38)
- Exonok
- 2 exon, összesen 7,6 kb
- Fehérje
- 475 aminosav
- Más néven ismert
- DKFZp727A071
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000371279.4NM_152268.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pars2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PARS2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Epilepsy (Full Panel)
- Epilepsy
A 171 hozzá kapcsolódó gén egyike
A brain disorder characterized by episodes of abnormally increased neuronal discharge resulting in transient episodes of sensory or motor neurological dysfunction, or psychic dysfunction. These episodes may or may not be associated with loss of consciousness or convulsions.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A PARS2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 7,6 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1428 bázis kódolja a fehérjét.
PARS2 szekvenálása
0Alacsony
Mennyire nehéz a PARS2 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy PARS2 exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.0%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.2,7%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
3
a PARS2 génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a PARS2 gén mind a 7,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 2,4 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 betegséget oszt meg
- ACTL6Bactin like 6B1 betegséget oszt meg
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 betegséget oszt meg
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 betegséget oszt meg
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 betegséget oszt meg
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 21 betegséget oszt meg
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 91 betegséget oszt meg
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulator1 betegséget oszt meg
- ARXaristaless related homeobox1 betegséget oszt meg
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 21 betegséget oszt meg
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 31 betegséget oszt meg
A(z) PARS2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PARS2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Hypsarrhythmia
- Encephalopathy
- Abnormality of coordination
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
Még 29 tulajdonság megjelenítése
- EEG with multifocal slow activity
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Impulsivity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Tremor
- Unsteady walk
- Repeated seizures without recovery between them
- Babinski sign
- CNS hypomyelination
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Epileptic encephalopathy
- Frontal cortical atrophy
- Increased reflexes
- Profound global developmental delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
Abnormality of head or neck
- Development of small head that was not present at birth
- Abnormally small head
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Failure of development of between one and six teeth
- High forehead
- Nasal tip, upturned
- Open mouth
- Short chin
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Abnormality of the eye
- Drooping upper eyelid
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal involuntary eye movements
- Abnormality of vision
- Optic atrophy
- Retina degeneration
- Bulging eye
- Cerebral visual impairment
Még 2 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PARS2 gén: prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pars2
Dante Labs. PARS2 gén: prolyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pars2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt