Gén
PCSK9
proprotein convertase subtilisin/kexin type 9
- HGNC 20001↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000169174↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 255738↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1p32.3
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 55 039 548–55 064 852 (GRCh38)
- Exonok
- 12 exon, összesen 25,3 kb
- Fehérje
- 692 aminosav
- Más néven ismert
- NARC-1, FH3
- Korábbi jelölések
- HCHOLA3
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000302118.5NM_174936.4
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pcsk9.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a PCSK9-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Familial Hypercholesterolemia
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
▶Beavatkozhatóság
Statins, ezetimibe, PCSK9 inhibitors, bempedoic acid, inclisiran
Hyperlipidemia
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Szerepel az ACMG másodlagos leletek listáján
A PCSK9 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 25,3 kb-jából 3,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2079 bázis kódolja a fehérjét.
PCSK9 szekvenálása
18
PCSK9-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem olyan régióba esik, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
A teljes genomszekvenálás a PCSK9 gén mind a 25,3 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 3,6 kb-át.
Oldallal rendelkező variánsok (6)
Az itt található, oldallal rendelkező PCSK9 variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| D129G | c.386A>G | 2. exon | 55 044 021 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| D374Y | c.1120G>T | 7. exon | 55 057 454 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| E32K | c.94G>A | 1. exon | 55 039 931 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| L108R | c.323T>G | 2. exon | 55 043 958 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| R215H | c.644G>A | 4. exon | 55 052 398 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| S127R | c.381T>A | 2. exon | 55 044 016 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- APOBapolipoprotein B2 betegséget oszt meg
- LDLRlow density lipoprotein receptor2 betegséget oszt meg
- LDLRAP1low density lipoprotein receptor adaptor protein 12 betegséget oszt meg
- APOA5apolipoprotein A51 betegséget oszt meg
- APOC2apolipoprotein C21 betegséget oszt meg
- APOEapolipoprotein E1 betegséget oszt meg
- CETPcholesteryl ester transfer protein1 betegséget oszt meg
- GPIHBP1glycosylphosphatidylinositol anchored high density lipoprotein binding protein 11 betegséget oszt meg
- LIPClipase C, hepatic type1 betegséget oszt meg
- LPLlipoprotein lipase1 betegséget oszt meg
A(z) PCSK9 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) PCSK9 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the cardiovascular system
- Premature hardening of arteries
- Premature plaque build-up in arteries
- Abnormal left ventricular function
- Angina pectoris
- Aortic atherosclerotic lesion
- Heart attack
- Heart murmur
- High blood pressure
Még 11 tulajdonság megjelenítése
- Myocardial steatosis
- Narrowing of kidney artery
- Peripheral arterial stenosis
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Plaque build-up in cerebral artery
- Premature coronary artery disease
- Sudden cardiac death
- Calcification of the aorta
- Mitral regurgitation
- Supravalvular aortic stenosis
- Coronary artery aneurysm
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). PCSK9 gén: proprotein convertase subtilisin/kexin type 9. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/pcsk9
Dante Labs. PCSK9 gén: proprotein convertase subtilisin/kexin type 9 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/pcsk9
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt