Gén
GCH1
GTP cyclohydrolase 1
- HGNC 4193↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000131979↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 2643↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 14q22.2
- Koordináták
- 14. kromoszóma: 54 842 017–54 902 826 (GRCh38)
- Exonok
- 6 exon, összesen 60,8 kb
- Fehérje
- 250 aminosav
- Más néven ismert
- GTPCH1, DYT5a
- Korábbi jelölések
- GCH, DYT5, DYT14
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000491895.7NM_000161.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gch1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a GCH1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
BH4 Deficiency & Monoamine Neurotransmitter Disorders
- Hyperphenylalaninemia due to BH4 DeficiencyAutoszomális recesszív
Caused by variants in PTS, QDPR, PCBD1 or GCH1, which raise phenylalanine and reduce dopamine and serotonin, leading to movement problems, seizures and developmental delay.
- 3 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing allows treatment with BH4, neurotransmitter precursors (L-dopa, 5-hydroxytryptophan) and folinic acid where needed.
Dystonia, Myotonia, Paroxysmal Dyskinesia
- Dystonia 5
An autosomal dominant dopa-responsive dystonia in which the cause of the disease is a variation in the GCH1 gene.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Inherited Dystonia
Umbrella term covering inherited dystonias, including DYT-TOR1A early-onset generalized dystonia, DYT-THAP1, myoclonus-dystonia (SGCE) and KMT2B-related dystonia.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
GTP Cyclohydrolase 1 Deficiency
Caused by changes in GCH1, which encodes the first enzyme in making tetrahydrobiopterin (BH4), a cofactor needed to produce dopamine and serotonin. A change in one copy causes dopa-responsive dystonia, often with reduced penetrance, while changes in both copies cause severe deficiency.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 7 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Dopa-responsive dystonia responds dramatically and lastingly to low doses of levodopa, so recognising it is important. The recessive form needs specialist metabolic care. Genetic counselling and testing of relatives are appropriate, noting that people with one changed copy may never develop symptoms.
A GCH1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 60,8 kb-jából 2,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 753 bázis kódolja a fehérjét.
GCH1 szekvenálása
76
a GCH1 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a GCH1 mind a 60,8 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 2,9 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (89)
The GCH1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 65
- Patogén/valószínűleg patogén 2
- Valószínűleg patogén 22
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_000161.3(GCH1):c.646C>T (p.Arg216Ter) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.626+1G>A (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.626+1G>T (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.614T>A (p.Val205Glu) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.607G>A (p.Gly203Arg) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.551G>A (p.Arg184His) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.550C>T (p.Arg184Cys) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.250G>T (p.Glu84Ter) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.76del (p.Asp26fs) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.671A>G (p.Lys224Arg) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.631_632del (p.Met211fs) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.626+2_626+3insTT (opens in a new tab) | dystonia 5 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.281C>T (p.Thr94Met) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_000161.3(GCH1):c.751T>C (p.Ter251Arg) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.728dup (p.Phe244fs) (opens in a new tab) | dystonia 5 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.724G>T (p.Glu242Ter) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.667A>G (p.Ser223Gly) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency with hyperphenylalaninemia | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.655C>T (p.Gln219Ter) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.626+2dup (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.626+2T>C (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.607G>C (p.Gly203Arg) (opens in a new tab) | dystonia 5 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.601G>T (p.Gly201Ter) (opens in a new tab) | dystonia 5 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.601G>C (p.Gly201Arg) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.597del (p.Ala200fs) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_000161.3(GCH1):c.578_583del (p.Ile193_Glu195delinsLys) (opens in a new tab) | GTP cyclohydrolase I deficiency and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
See all 89 with every other GCH1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- SPRsepiapterin reductase2 betegséget oszt meg
- ACTBactin beta1 betegséget oszt meg
- ANO3anoctamin 31 betegséget oszt meg
- ARFGEF3ARFGEF family member 31 betegséget oszt meg
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 31 betegséget oszt meg
- BCAP31B cell receptor associated protein 311 betegséget oszt meg
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chain1 betegséget oszt meg
- DCAF17DDB1 and CUL4 associated factor 171 betegséget oszt meg
- GNALG protein subunit alpha L1 betegséget oszt meg
- HPCAhippocalcin1 betegséget oszt meg
- KCNJ10potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 101 betegséget oszt meg
- KCTD17potassium channel tetramerization domain containing 171 betegséget oszt meg
A(z) GCH1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) GCH1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Choreoathetosis
- Dystonia
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Parkinsonism with favorable response to dopaminergic medication
- Tremor
- Abnormal substantia nigra morphology
Még 29 tulajdonság megjelenítése
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Anxiety
- Ataxia
- Babinski sign
- Brisk reflexes
- Depression
- Difficulty articulating speech
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Difficulty sleeping
- Focal dystonia
- Inability to coordinate movements when walking
- Incoordination
- Jaw hyperreflexia
- Limb dystonia
- Overactive lower leg reflex
- Parkinsonism
- Postural tremor
- Slow movements
- Generalized dystonia
- Impaired distal vibration sensation
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Obsessive compulsive behavior
- Resting tremor
- Hyperactive movements
- Intellectual disability
- Irritability
- Lethargy
- Worsening neurological symptoms
- Writer's cramp
Abnormality of the musculoskeletal system
- Generalized decreased muscle tone
- Low muscle tone
- Rigidity
- Cogwheel rigidity
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Progressive flexion contractures
- Rheumatoid arthritis
- Scoliosis
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). GCH1 gén: GTP cyclohydrolase 1. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/gch1
Dante Labs. GCH1 gén: GTP cyclohydrolase 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/gch1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt