Gène
PKP1
plakophilin 1
- HGNC 9023↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000081277↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 5317↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 1q32.1
- Coordonnées
- Chromosome 1 : 201 283 506–201 332 989 (GRCh38)
- Exons
- 14 exons sur 49,5 kb
- Protéine
- 726 acides aminés
- Aussi appelé
- B6P
- Transcrit MANE Select
- ENST00000367324.8NM_001005337.3
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Épidermolyse bulleuse
- Épidermolyse bulleuse héréditaire
Toutes les formes héréditaires de fragilité cutanée avec formation de cloques, notamment l'épidermolyse bulleuse simple, jonctionnelle et dystrophique, ainsi que le syndrome de Kindler.
- 5 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Les formes dystrophiques récessives nécessitent une surveillance régulière pour le cancer de la peau, et une thérapie cicatrisante basée sur les gènes est désormais disponible pour l'épidermolyse bulleuse dystrophique.
Structure de PKP1
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 5,3 kb sur les 49,5 kb du gène ; 2 181 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit PKP1
2
positions dans PKP1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 49,5 kb de PKP1, introns compris, et pas seulement les 5,3 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Partage 1 affection
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainPartage 1 affection
- COL7A1collagen type VII alpha 1 chainPartage 1 affection
- DSPdesmoplakinPartage 1 affection
- DSTdystoninPartage 1 affection
- EXPH5exophilin 5Partage 1 affection
- FERMT1FERM domain containing kindlin 1Partage 1 affection
- ITGA3integrin subunit alpha 3Partage 1 affection
- ITGA6integrin subunit alpha 6Partage 1 affection
- ITGB4integrin subunit beta 4Partage 1 affection
- JUPjunction plakoglobinPartage 1 affection
- KLHL24kelch like family member 24Partage 1 affection
Traits associés à PKP1
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que PKP1 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the integument
- Abnormal blistering of the skin
- Fragile skin
- Lack of sweating
- Poor fingernail formation
- Poor nail formation
- Scaling skin
- Sparse hair
- Alopecia universalis
Afficher 4 traits supplémentaires
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chapped lip
- Abnormal dentition
- Abnormal tongue morphology
- Abnormality of dental shape
- Dental cavities
Afficher 1 trait supplémentaire
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène PKP1 : plakophilin 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/pkp1
Dante Labs. Gène PKP1 : plakophilin 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/pkp1
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