Gen
PKP1
plakophilin 1
- HGNC 9023↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000081277↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 5317↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1q32.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 201.283.506–201.332.989 (GRCh38)
- Exoner
- 14 exoner fordelt over 49,5 kb
- Protein
- 726 aminosyrer
- Også kendt som
- B6P
- MANE Select-transkript
- ENST00000367324.8NM_001005337.3
- Lokustype
- Protein-coding
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
Denne side som data
Tilføj .json til sidens adresse, eller bed om application/json, for at læse den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pkp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLæs PKP1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Epidermolysis bullosa
- Arvelig epidermolysis bullosa
Alle arvelige former for hudskørhed med blæredannelse, herunder simplex-, junktional- og dystrofisk epidermolysis bullosa samt Kindlers syndrom.
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
▶Handlingsrelevans
Recessive dystrofiske former kræver regelmæssig overvågning for hudkræft, og genbaseret sårbehandling er nu tilgængelig ved dystrofisk EB.
Sådan er PKP1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 5,3 kb af genets 49,5 kb; 2.181 af disse baser koder for proteinet.
Sekventering af PKP1
2
positioner i PKP1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved at dække.
En helgenomsanalyse dækker alle 49,5 kb af PKP1, inklusive introner, og ikke kun de 5,3 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Deler 1 sygdom
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainDeler 1 sygdom
- COL7A1collagen type VII alpha 1 chainDeler 1 sygdom
- DSPdesmoplakinDeler 1 sygdom
- DSTdystoninDeler 1 sygdom
- EXPH5exophilin 5Deler 1 sygdom
- FERMT1FERM domain containing kindlin 1Deler 1 sygdom
- ITGA3integrin subunit alpha 3Deler 1 sygdom
- ITGA6integrin subunit alpha 6Deler 1 sygdom
- ITGB4integrin subunit beta 4Deler 1 sygdom
- JUPjunction plakoglobinDeler 1 sygdom
- KLHL24kelch like family member 24Deler 1 sygdom
Træk knyttet til PKP1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, PKP1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-17: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.17-8666dff2.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). PKP1-genet: plakophilin 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/pkp1
Dante Labs. PKP1-genet: plakophilin 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/pkp1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger