Gen
PKP1
plakophilin 1
- HGNC 9023↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000081277↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 5317↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1q32.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 201 283 506–201 332 989 (GRCh38)
- Eksoner
- 14 eksoner over 49,5 kb
- Protein
- 726 aminosyrer
- Også kjent som
- B6P
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000367324.8NM_001005337.3
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/pkp1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes PKP1 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuratert rapport som er relevant for dette genet
Epidermolysis bullosa
- Arvelig epidermolysis bullosa
Alle arvelige former for hudskjørhet med blemmedannelse, inkludert epidermolysis bullosa simplex, junksjonell og dystrofisk epidermolysis bullosa samt Kindlers syndrom.
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Recessive dystrofiske former krever regelmessig overvåkning for hudkreft, og genbasert sårbehandling finnes nå for dystrofisk EB.
Slik er PKP1 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 5,3 kb av genets 49,5 kb, og 2 181 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av PKP1
2
posisjoner i PKP1 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 49,5 kb av PKP1, inkludert introner, ikke bare de 5,3 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CD151CD151 molecule (Raph blood group)Deler 1 tilstand
- COL17A1collagen type XVII alpha 1 chainDeler 1 tilstand
- COL7A1collagen type VII alpha 1 chainDeler 1 tilstand
- DSPdesmoplakinDeler 1 tilstand
- DSTdystoninDeler 1 tilstand
- EXPH5exophilin 5Deler 1 tilstand
- FERMT1FERM domain containing kindlin 1Deler 1 tilstand
- ITGA3integrin subunit alpha 3Deler 1 tilstand
- ITGA6integrin subunit alpha 6Deler 1 tilstand
- ITGB4integrin subunit beta 4Deler 1 tilstand
- JUPjunction plakoglobinDeler 1 tilstand
- KLHL24kelch like family member 24Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til PKP1
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene PKP1 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the integument
- Abnormal blistering of the skin
- Fragile skin
- Lack of sweating
- Poor fingernail formation
- Poor nail formation
- Scaling skin
- Sparse hair
- Alopecia universalis
Vis 4 egenskaper til
Abnormality of head or neck
- Absence of scalp hair
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Chapped lip
- Abnormal dentition
- Abnormal tongue morphology
- Abnormality of dental shape
- Dental cavities
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). PKP1-genet: plakophilin 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/pkp1
Dante Labs. PKP1-genet: plakophilin 1 [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/pkp1
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker