Gène
IGHMBP2
immunoglobulin mu DNA binding protein 2
- HGNC 5542↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000132740↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 3508↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 11q13.3
- Coordonnées
- Chromosome 11 : 68 903 891–68 940 601 (GRCh38)
- Exons
- 15 exons sur 36,7 kb
- Protéine
- 993 acides aminés
- Aussi appelé
- ZFAND7, SMUBP2, CATF1, SMARD1, HCSA, HMN6, CMT2S
- Transcrit MANE Select
- ENST00000255078.8NM_002180.3
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Cette page en données
Ajoutez .json à l'adresse de la page, ou demandez application/json, pour la lire au format JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/ighmbp2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLisez IGHMBP2, et le reste de votre génome, avec un seul test.
À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines
Obtenir mon Genome TestRapports d'expertise pertinents pour ce gène
Maladie de Charcot-Marie-Tooth
- Neuropathie motrice héréditaire distale
Neuropathies héréditaires touchant principalement les nerfs moteurs, provoquant une faiblesse et une atrophie des mains et des pieds, y compris la neuropathie liée à SORD.
- 4 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
L'un des 62 gènes qui lui sont liés
Un groupe de neuropathies périphériques héréditaires provoquant une faiblesse et une fonte progressives des muscles distaux ainsi qu'une perte de sensibilité, touchant principalement les pieds et les mains.
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Conseil génétique, suivi spécifique au sous-type, kinésithérapie, orthèses, éviction des médicaments neurotoxiques, essais cliniques ciblant des gènes spécifiques, surveillance des manifestations associées
Amyotrophie spinale
Groupe d'affections caractérisées par la dégénérescence des cellules de la corne antérieure de la moelle épinière, entraînant une faiblesse et une atrophie musculaires progressives.
- 4 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Thérapie génique (onasemnogene abeparvovec), traitement par oligonucléotides antisens (nusinersen), modulateur d'épissage par voie orale (risdiplam), soins de support
Regroupements plus larges
Maladies neurodégénératives héréditaires
- Maladie neurodégénérative liée à KIF5AAutosomique dominant
L'un des 372 gènes qui lui sont liés
Causée par des modifications d'une copie du gène KIF5A, qui code une protéine motrice dotée d'une queue de liaison à sa cargaison. Différents types de modifications entraînent différentes affections : la paraplégie spastique héréditaire de type 10, une forme axonale de la maladie de Charcot-Marie-Tooth et la sclérose latérale amyotrophique (SLA).
- 4 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La prise en charge est symptomatique et dépend de la forme clinique ; elle comprend la kinésithérapie, des médicaments contre la spasticité et un suivi pluridisciplinaire de la SLA. Chaque enfant d'une personne atteinte a une chance sur 2 d'hériter de la modification ; le conseil génétique aide les familles à comprendre ce risque.
Neuropathies périphériques héréditaires rares
- Neuropathie périphérique héréditaire
L'un des 233 gènes qui lui sont liés
Causée par des modifications dans l'un des nombreux gènes nécessaires au maintien en bon état des longues fibres nerveuses. Dans ce rapport, ces gènes comprennent IGHMBP2 et PLEKHG5, dont la transmission est récessive.
- ClinGen juge le lien définitif
- 7 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La kinésithérapie, les orthèses et l'ergothérapie aident à préserver la mobilité, avec une chirurgie des déformations du pied si nécessaire. Certaines formes nécessitent une surveillance respiratoire. Le conseil génétique oriente le dépistage familial selon le mode de transmission du gène concerné.
Structure de IGHMBP2
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 3,9 kb sur les 36,7 kb du gène ; 2 982 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de IGHMBP2
7Facile
Difficulté de séquençage de IGHMBP2 avec des lectures courtes, sur 100
0 · Facile100 · Difficile
Presque tous les exons de IGHMBP2 se trouvent dans des zones où les lectures courtes s'alignent correctement.
Ce qui s'y ajoute : la part des exons de IGHMBP2 dans chaque type de zone difficile
- MappabilitéPortions où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, un appel effectué à cet endroit pouvant donc être manquant ou erroné. Poids 100 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 60 %.0 %
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Poids 60 %.0 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 50 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles risquent de ne pas couvrir entièrement. Poids 30 %.1,2 %
- Teneur en GCFenêtres contenant moins de 25 % ou plus de 65 % de G et de C, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 20 %.33 %
Un score Dante Labs issu de nos propres recherches, fondé sur les cartes de régions difficiles à séquencer du projet Genome in a Bottle du NIST.Mode de calcul du scoreChaque barre représente la part des bases exoniques de IGHMBP2 situées dans ce type de zone difficile. Un seul type peut suffire à rendre un gène difficile à analyser, et chaque type supplémentaire ajoute moins : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une zone de ce type, 100 lorsque chaque base se trouve dans une zone où les lectures ne peuvent pas être placées de façon unique.
157
positions de IGHMBP2 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une zone que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 36,7 kb de IGHMBP2, introns compris, et pas seulement les 3,9 kb d'exons.
ClinVar pathogenic variants (166)
The IGHMBP2 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 98
- Pathogène/probablement pathogène 26
- Probablement pathogène 42
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.138T>A (p.Cys46Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.292_303delinsATGCT (p.Gly98fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.388C>T (p.Arg130Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.439C>T (p.Arg147Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.449+1G>A (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.638A>G (p.His213Arg) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.791G>T (p.Arg264Leu) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.826C>T (p.Gln276Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.958C>T (p.Arg320Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1061-2A>G (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1082T>C (p.Leu361Pro) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1540G>A (p.Glu514Lys) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1708C>T (p.Arg570Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1730T>C (p.Leu577Pro) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1738G>A (p.Val580Ile) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.1813C>T (p.Arg605Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2356del (p.Ala786fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2362C>T (p.Arg788Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2368C>T (p.Arg790Ter) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2540del (p.Gln847fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2598_2601del (p.Lys868fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2611+1G>T (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2796del (p.Cys932fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2911_2912del (p.Arg971fs) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease and 2 others | Pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
| NM_002180.3(IGHMBP2):c.2T>C (p.Met1Thr) (opens in a new tab) | Charcot-Marie-Tooth disease axonal type 2S and 1 other | Pathogène/probablement pathogène | ★★★★2 étoiles sur 4 critères fournis, plusieurs soumetteurs, sans conflit |
See all 166 with every other IGHMBP2 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gènes liés aux mêmes affections
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Partage 5 affections
- GARS1glycyl-tRNA synthetase 1Partage 5 affections
- HSPB8heat shock protein family B (small) member 8Partage 5 affections
- PLEKHG5pleckstrin homology and RhoGEF domain containing G5Partage 5 affections
- ATP7AATPase copper transporting alphaPartage 4 affections
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinPartage 4 affections
- DCTN1dynactin subunit 1Partage 4 affections
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Partage 4 affections
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Partage 4 affections
- FBXO38F-box protein 38Partage 4 affections
- REEP1receptor accessory protein 1Partage 4 affections
- SIGMAR1sigma receptor chaperone 1Partage 4 affections
Traits associés à IGHMBP2
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que IGHMBP2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Diaphragmatic eventration
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Scoliosis
- Denervation of the diaphragm
- Diaphragmatic paralysis
- Distal muscle wasting
- EMG: neuropathic changes
Afficher 3 traits supplémentaires
Abnormality of the nervous system
- Decreased sensation in extremities
- Abnormal gait
- Axonal degeneration
- Decreased nerve conduction velocity
- Decreased reflex response
- Degeneration of anterior horn cells
- High stepping
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
Afficher 1 trait supplémentaire
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-19 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.19-9814e911.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène IGHMBP2 : immunoglobulin mu DNA binding protein 2. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/ighmbp2
Dante Labs. Gène IGHMBP2 : immunoglobulin mu DNA binding protein 2 [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/ighmbp2
Un seul test. Des réponses pour toute la vie.
À partir de 449 $Livraison gratuite · Résultats sous 6 à 8 semaines