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Gène

ATR

ATR checkpoint kinase

Résumé

Localisation cytogénétique
3q23
Coordonnées
Chromosome 3 : 142 449 235–142 578 733 (GRCh38)
Exons
47 exons sur 129,5 kb
Protéine
2 644 acides aminés
Aussi appelé
FRP1, SCKL, SCKL1, MEC1
Transcrit MANE Select
ENST00000350721.9NM_001184.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore ATR. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de ATR

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 3, avec un crochet à l'emplacement de ATR. ATR et 8 gènes à proximité sur le chromosome 3, de 142 013 984 à 143 013 983.Chromosome 33q23p26.3p26.2p26.1p25.3p25.2p25.1p24.3p24.2p24.1p23p22.3p22.2p22.1p21.33p21.32p21.31p21.2p21.1p14.3p14.2p14.1p13p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.11q13.12q13.13q13.2q13.31q13.32q13.33q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25.1q25.2q25.31q25.32q25.33q26.1q26.2q26.31q26.32q26.33q27.1q27.2q27.3q28q29142,2 Mb142,4 Mb142,6 Mb142,8 Mb143 MbTFDP2 : 141 944 428–142 149 598, brin inverseTFDP2GK5 : 142 157 527–142 225 620, brin inverseGK5XRN1 : 142 306 607–142 448 087, brin inverseXRN1ATR : 142 449 235–142 578 733, brin inverseATRPLS1 : 142 595 644–142 713 869, brin directPLS1TRPC1 : 142 724 000–142 807 888, brin directTRPC1PCOLCE2 : 142 815 922–142 889 211, brin inversePCOLCE2PAQR9 : 142 949 164–142 964 022, brin inversePAQR9U2SURP : 142 964 497–143 061 401, brin directU2SURPSchéma de ATR : 47 exons sur le brin inverse du chromosome 3Exon 45 : 2 sites connus associés à une maladieExon 43 : 2 sites connus associés à une maladieExon 40 : 1 site connu associé à une maladieExon 34 : 1 site connu associé à une maladieExon 30 : 1 site connu associé à une maladieExon 28 : 2 sites connus associés à une maladieExon 22 : 1 site connu associé à une maladieExon 17 : 1 site connu associé à une maladieExon 10 : 1 site connu associé à une maladieExon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 47 : 142 449 235–142 449 602, 368 basesExon 46 : 142 453 128–142 453 233, 106 basesExon 45 : 142 457 604–142 457 755, 152 basesExon 44 : 142 458 958–142 459 111, 154 basesExon 43 : 142 459 227–142 459 383, 157 basesExon 42 : 142 461 940–142 462 090, 151 basesExon 41 : 142 465 097–142 465 240, 144 basesExon 40 : 142 466 324–142 466 533, 210 basesExon 39 : 142 467 934–142 468 068, 135 basesExon 38 : 142 469 337–142 469 569, 233 basesExon 37 : 142 470 086–142 470 183, 98 basesExon 36 : 142 485 140–142 485 282, 143 basesExon 35 : 142 493 132–142 493 311, 180 basesExon 34 : 142 496 361–142 496 520, 160 basesExon 33 : 142 497 013–142 497 192, 180 basesExon 32 : 142 498 597–142 498 774, 178 basesExon 31 : 142 499 627–142 499 718, 92 basesExon 30 : 142 503 362–142 503 453, 92 basesExon 29 : 142 505 139–142 505 303, 165 basesExon 28 : 142 507 931–142 508 109, 179 basesExon 27 : 142 512 260–142 512 470, 211 basesExon 26 : 142 513 501–142 513 638, 138 basesExon 25 : 142 515 395–142 515 515, 121 basesExon 24 : 142 519 669–142 519 784, 116 basesExon 23 : 142 522 728–142 522 841, 114 basesExon 22 : 142 523 993–142 524 199, 207 basesExon 21 : 142 535 080–142 535 205, 126 basesExon 20 : 142 536 108–142 536 201, 94 basesExon 19 : 142 538 482–142 538 625, 144 basesExon 18 : 142 540 904–142 541 034, 131 basesExon 17 : 142 542 665–142 542 757, 93 basesExon 16 : 142 547 725–142 547 910, 186 basesExon 15 : 142 549 479–142 549 673, 195 basesExon 14 : 142 550 132–142 550 302, 171 basesExon 13 : 142 553 227–142 553 398, 172 basesExon 12 : 142 553 640–142 553 740, 101 basesExon 11 : 142 553 825–142 554 015, 191 basesExon 10 : 142 555 877–142 556 139, 263 basesExon 9 : 142 556 383–142 556 575, 193 basesExon 8 : 142 558 624–142 558 776, 153 basesExon 7 : 142 559 251–142 559 441, 191 basesExon 6 : 142 560 263–142 560 454, 192 basesExon 5 : 142 561 243–142 561 421, 179 basesExon 4 : 142 562 232–142 563 109, 878 basesExon 3 : 142 566 121–142 566 261, 141 basesExon 2 : 142 568 063–142 568 154, 92 basesExon 1 : 142 578 646–142 578 733, 88 bases474540353025201510515′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 8,2 kb sur les 129,5 kb du gène ; 7 935 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit ATR

17

positions dans ATR où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 129,5 kb de ATR, introns compris, et pas seulement les 8,2 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène ATR : ATR checkpoint kinase. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/atr

Vancouver

Dante Labs. Gène ATR : ATR checkpoint kinase [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/atr

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