Geeni
LRRK1
leucine rich repeat kinase 1
- HGNC 18608↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000154237↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 79705↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 15q26.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 15: 100 919 357–101 078 257 (GRCh38)
- Eksonit
- 34 eksonia 158,9 kb:n alueella
- Proteiini
- 2 015 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- FLJ23119, KIAA1790, ROCO1, RIPK6
- MANE Select -transkripti
- ENST00000388948.8NM_024652.6
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/lrrk1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue LRRK1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Osteopetroosi
Osteopetroosi, joka tunnetaan myös marmoriluutautina, on kuvaava nimitys ryhmälle harvinaisia, periytyviä luuston sairauksia, joille on tunnusomaista lisääntynyt luun tiheys röntgenkuvissa.
- 1 GenCC-arvioija pitää sitä varmana tai vahvana
LRRK1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 15,7 kb geenin 158,9 kb:stä; 6 048 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: LRRK1
6
LRRK1-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 158,9 kb geenistä LRRK1, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 15,7 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- AMER1APC membrane recruitment protein 1Yhteinen sairaus: 1
- CA2carbonic anhydrase 2Yhteinen sairaus: 1
- CLCN7Cl-/H+ antiporter 7Yhteinen sairaus: 1
- CTSKcathepsin KYhteinen sairaus: 1
- FERMT3FERM domain containing kindlin 3Yhteinen sairaus: 1
- LRP5LDL receptor related protein 5Yhteinen sairaus: 1
- OSTM1osteoclastogenesis associated transmembrane protein 1Yhteinen sairaus: 1
- PLEKHM1pleckstrin homology and RUN domain containing M1Yhteinen sairaus: 1
- RASGRP2RAS guanyl releasing protein 2Yhteinen sairaus: 1
- SNX10sorting nexin 10Yhteinen sairaus: 1
- TCIRG1T cell immune regulator 1, ATPase H+ transporting V0 subunit a3Yhteinen sairaus: 1
- TNFRSF11ATNF receptor superfamily member 11aYhteinen sairaus: 1
Geeniin LRRK1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita LRRK1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). LRRK1-geeni: leucine rich repeat kinase 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/lrrk1
Dante Labs. LRRK1-geeni: leucine rich repeat kinase 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/lrrk1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa