Geen
TRPS1
transcriptional repressor GATA binding 1
- HGNC 12340↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000104447↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 7227↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 8q23.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 8: 115 408 496–115 668 975 (GRCh38)
- Eksonid
- 7 eksonit, ulatus 260,5 kb
- Valk
- 1294 aminohapet
- Tuntud ka kui
- LGCR, GC79
- MANE Select transkript
- ENST00000395715.8NM_014112.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe TRPS1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni TRPS1 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.
Kuidas TRPS1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 10 kb kogupikkusega 260,5 kb; neist 3885 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse TRPS1
126
kohad geenis TRPS1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni TRPS1 260,5 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (10 kb).
Geeniga TRPS1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida TRPS1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of head or neck
- Bulbous nose
- Limited hair on end of eyebrow
- Long philtrum
- Smooth philtrum
- Sparse scalp hair
- Thin red part of the upper lip
- Deep philtrum
- Frontal bossing
Näita veel 24 tunnust
- Little lower jaw
- Long upper lip
- Sparse eyebrow
- Sparse eyelashes
- Triangular face
- Abnormal dentition
- Aplasia/Hypoplasia of the mandible
- Extra teeth
- High palate
- Thick eyebrow
- Abnormality of the palate
- Abnormally small head
- Thick nasal alae
- Wide nasal bridge
- Bad bite
- Chin with horizontal crease
- Decreased size of tooth
- Delayed eruption of teeth
- Dental cavities
- Dental crowding
- Narrow palate
- Pear-shaped nose
- Thin eyebrow
- Underdeveloped tissue around nostril
Abnormality of limbs
- Short fingers or toes
- Cone-shaped end part of finger bones
- Curvature of little finger
- Short long bone of foot
- Short outermost finger bone
- Shortened long bone of hand
- Shortening of all finger bones
- Avascular necrosis of the capital femoral epiphysis
Näita veel 16 tunnust
- Curvature of digit
- Permanent flexion of the finger
- Bilateral single transverse palmar creases
- Knock knees
- Talipes
- Cone-shaped end part of the innermost hand bones
- Cone-shaped end part of the middle hand bones
- Dropped arches
- Flat end part of innermost thighbone
- Increased bone density of end part of the outermost hand bones
- Short finger
- Short finger bones
- Short foot
- Short palm
- Swelling of innermost hinge joints
- Winged shoulder blade
Abnormality of the integument
- Fine hair
- Hyperkeratosis
- Sparse hair
- Brittle nails
- Loose redundant skin
- White discoloration of nails
- Slow-growing hair
- Spoon-shaped nails
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). TRPS1 geen: transcriptional repressor GATA binding 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/trps1
Dante Labs. TRPS1 geen: transcriptional repressor GATA binding 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/trps1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast