Geen
DIAPH1
diaphanous related formin 1
- HGNC 2876↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000131504↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1729↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 5q31.3
- Koordinaadid
- Kromosoom 5: 141 515 021–141 619 000 (GRCh38)
- Eksonid
- 28 eksonit, ulatus 104 kb
- Valk
- 1272 aminohapet
- Tuntud ka kui
- hDIA1, LFHL1, mDia1
- Varasemad tähised
- DFNA1
- MANE Select transkript
- ENST00000389054.8NM_005219.5
- Lookuse tüüp
- Valke kodeeriv
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/diaph1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe DIAPH1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Kuulmislangus ja kurtus
- Autosomaal-dominantne mittesündroomiline kuulmislangusAutosoomne dominantne
Mittesündroomilise kurtuse autosomaal-dominantne vorm.
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
- Mittesündroomiline pärilik kuulmislangus
Üks 97 sellega seotud geenist
Pärilik kuulmislangus ilma muude meditsiiniliste tunnusteta, sh levinud retsessiivsed vormid, mis on põhjustatud geenidest GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC ja paljudest teistest geenidest, samuti dominantsed, X-seotud ja mitokondriaalsed vormid.
- 1 GenCC esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Geneetilise põhjuse teadmine võib aidata otsustada kuulmistoe ja koklea-implantaadi kasutuse üle, hinnata sobivust geeniteraapia uuringutesse (näiteks OTOF) ning toetada perekonna nõustamist.
Ererditarne trombotsütopeeniad
- Ererditarne trombotsütopeenia
Haiguste rühm, mis põhjustab elukestvalt madalat trombotsüütide arvu ning on seotud geenidega, nagu MYH9, ANKRD26, ETV6, WAS, MPL, RBM8A, GATA1 ja MECOM, ning pärandub domineerivalt, retsessiivselt või X-seotult.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 2 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Geneetiline diagnoos aitab vältida eksdiagnoosi immuunse trombotsütopeenia kujul, mille korral määratakse tarbetult steroide või eemaldatakse põrn, ning juhib seotud neeru-, kuulmis- või verehaiguste jälgimist.
Kuidas DIAPH1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 5,7 kb kogupikkusega 104 kb; neist 3819 alust kodeerivad valku.
DIAPH1 sekventeerimine
2Madal
Kui raske on DIAPH1 lühikeste lugemitega sekventeerida, skaalal 0–100Iga riba näitab, kui suur osa DIAPH1 eksoni aluspaaridest asub sellist liiki keerulises piirkonnas. Skoor kaalub neid selle järgi, kui palju iga piirkond lühikeste lugemiste analüüsi raskendab: 0, kui ükski alus ei asu üheski piirkonnas, 100, kui iga alus asub kõigis neist.
- KaardistatavusLõigud, kus 100 või 250 aluspaari pikkuseid lugemeid ei saa üheselt paigutada, seega võib seal tehtud määrang puududa või olla vale. Kaal 35%.0%
- HomoloogiaSegmentaalsed duplikatsioonid: koopiad mujal genoomis, nagu paralogid ja pseudogeenid, vähemalt 90% identsusega. Kaal 30%.0%
- KordusedTandemkordused ja ühe aluse jooksud, millel lugemid libisevad ja mida need ei pruugi katta. Kaal 15%.9%
- GC-sisaldusAknad, kus G- ja C-osakaal on alla 25% või üle 65%; raamatukogu ettevalmistus katab neid nõrgalt. Kaal 10%.3,5%
- ViitekatvusLüngad lähedal asuvas viitekoostises, kuhu lugemised ei saa joonduda, sest järjestust seal ei ole. Kaal 10%.0%
45
positsioonid geenis DIAPH1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Ükski neist ei jää piirkonda, mida lühikesed lugemid raskesti leiavad.
Kogu genoomi sekventeerimine katab kogu DIAPH1 104 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 5,7 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- MYH9myosin heavy chain 9Jagab 3 haigust
- ACTG1actin gamma 1Jagab 2 haigust
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AJagab 2 haigust
- ATP2B2ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 2Jagab 2 haigust
- CD164CD164 moleculeJagab 2 haigust
- CEACAM16CEA cell adhesion molecule 16, tectorial membrane componentJagab 2 haigust
- COCHcochlinJagab 2 haigust
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainJagab 2 haigust
- COL11A2collagen type XI alpha 2 chainJagab 2 haigust
- EYA4EYA transcriptional coactivator and phosphatase 4Jagab 2 haigust
- GJB2gap junction protein beta 2Jagab 2 haigust
- GJB6gap junction protein beta 6Jagab 2 haigust
Geeniga DIAPH1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida DIAPH1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Low platelet count
- Macrothrombocytopenia
- Large platelets
- Iron deficiency anemia
- Low blood neutrophil count
- Abnormally heavy bleeding during menstruation
- B-cell lymphoma
- Bleeding post-delivery
Näita veel 2 tunnust
Abnormality of the nervous system
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- IQ less than 20
- Intellectual disability
- Ventriculomegaly
- Brain degeneration
- Thin corpus callosum
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljalase 2026-10-17: millised seisundid geeniga on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB stratifikatsioonid: teadaolevad haigust põhjustavad kohad ja piirkonnad, mida lühikestel lugemistel on raske leida.
- Genome in a Bottle genoomi stratifikatsioonid, NIST: järjestamise raskusastme skoor.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljalase 2026.10.18-e609d43e.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). DIAPH1 geen: diaphanous related formin 1. Vaadatud 18. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/diaph1
Dante Labs. DIAPH1 geen: diaphanous related formin 1 [Internet]. [viidatud 18. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/diaph1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast