Liigu sisu juurde
Kasuta oma HSA- või FSA-vahendeid
Sekveneeri oma genoom (avaneb uuel vahelehel)

Geen

PCDHGC4

protocadherin gamma subfamily C, 4

Kokkuvõte

Tsütogeneetiline asukoht
5q31.3
Koordinaadid
Kromosoom 5: 141 485 030–141 512 975 (GRCh38)
Eksonid
4 eksonit, ulatus 27,9 kb
Valk
938 aminohapet
Tuntud ka kui
PCDH-GAMMA-C4
MANE Select transkript
ENST00000306593.2NM_018928.3
Lookuse tüüp
complex locus constituent
  • Väga kõrge
  • Kindel
  • Madal
  • Väga madal

Selle geeniga seotud kureeritud aruanded

Ükski Genome Testi aruanne ei loe geeni PCDHGC4 veel. Test sekveneerib sinu kogu genoomi, seega hõlmavad sinu andmed seda sellegipoolest.

Kuidas PCDHGC4 on üles ehitatud

  • Kodeeriv järjestus
  • Transleerimata piirkond
  • Intron
  • Transkriptsiooni suund
  • Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
  • Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Kromosoom 5, millel on sulg kohal, kus asub PCDHGC4. PCDHGC4 ja sellele lähedal asuvad 65 geeni kromosoomil 5, vahemikus 140 999 003 kuni 141 999 002.Kromosoom 55q31.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.3141 Mb141,2 Mb141,4 Mb141,6 Mb141,8 MbPCDHA1: 140 786 136–141 012 351, otsene ahelPCDHA2: 140 794 845–141 012 351, otsene ahelPCDHA3: 140 801 018–141 012 351, otsene ahelPCDHA4: 140 807 037–141 012 347, otsene ahelPCDHA5: 140 821 599–141 012 347, otsene ahelPCDHA6: 140 827 958–141 012 351, otsene ahelPCDHA7: 140 834 231–141 012 351, otsene ahelPCDHA8: 140 841 185–141 012 351, otsene ahelPCDHA9: 140 847 772–141 012 351, otsene ahelPCDHA10: 140 855 883–141 012 351, otsene ahelPCDHA11: 140 868 183–141 012 351, otsene ahelPCDHA12: 140 875 256–141 012 351, otsene ahelPCDHA13: 140 882 079–141 012 347, otsene ahelPCDHA13PCDHAC1: 140 926 299–141 012 351, otsene ahelPCDHAC1PCDHAC2: 140 966 466–141 012 351, otsene ahelPCDHAC2PCDHB1: 141 051 374–141 059 346, otsene ahelPCDHB1PCDHB2: 141 094 597–141 098 703, otsene ahelPCDHB3: 141 100 473–141 103 827, otsene ahelPCDHB3PCDHB4: 141 121 818–141 125 623, otsene ahelPCDHB4PCDHB5: 141 135 206–141 138 615, otsene ahelPCDHB5PCDHB6: 141 150 057–141 153 287, otsene ahelPCDHB6PCDHB7: 141 172 644–141 176 383, otsene ahelPCDHB8: 141 177 790–141 182 369, otsene ahelPCDHB8PCDHB16: 141 182 387–141 186 226, otsene ahelPCDHB9: 141 187 127–141 191 541, otsene ahelPCDHB10: 141 192 353–141 195 647, otsene ahelPCDHB11: 141 199 610–141 203 779, otsene ahelPCDHB12: 141 208 697–141 212 571, otsene ahelPCDHB13: 141 213 919–141 218 979, otsene ahelPCDHB13PCDHB14: 141 223 343–141 227 759, otsene ahelPCDHB14: 141 223 372–141 245 861, otsene ahelPCDHB15: 141 245 395–141 249 365, otsene ahelPCDHB15TAF7: 141 259 884–141 320 784, pöördne ahelTAF7SLC25A2: 141 302 635–141 304 049, pöördne ahelSLC25A2PCDHGA1: 141 330 495–141 512 977, otsene ahelPCDHGA2: 141 338 754–141 512 977, otsene ahelPCDHGA3: 141 343 819–141 512 977, otsene ahelPCDHGB1: 141 350 083–141 512 977, otsene ahelPCDHGA4: 141 355 004–141 512 977, otsene ahelPCDHGB2: 141 359 971–141 512 977, otsene ahelPCDHGA5: 141 364 162–141 512 977, otsene ahelPCDHGB3: 141 370 237–141 512 977, otsene ahelPCDHGA6: 141 373 878–141 512 977, otsene ahelPCDHGA7: 141 382 702–141 512 977, otsene ahelPCDHGB4: 141 387 698–141 512 977, otsene ahelPCDHGA8: 141 390 157–141 512 977, otsene ahelPCDHGB5: 141 397 942–141 512 977, otsene ahelPCDHGA9: 141 402 765–141 512 977, otsene ahelPCDHGB6: 141 407 989–141 512 977, otsene ahelPCDHGA10: 141 412 981–141 512 977, otsene ahelPCDHGB7: 141 417 642–141 512 977, otsene ahelPCDHGA11: 141 421 021–141 512 977, otsene ahelPCDHGA12: 141 430 507–141 512 977, otsene ahelPCDHGA12PCDHGC3: 141 475 929–141 512 977, otsene ahelPCDHGC3PCDHGC4: 141 485 030–141 512 975, otsene ahelPCDHGC4PCDHGC5: 141 489 067–141 512 977, otsene ahelPCDHGC5DIAPH1: 141 515 016–141 619 194, pöördne ahelHDAC3: 141 620 766–141 637 304, pöördne ahelHDAC3RELL2: 141 636 950–141 641 065, otsene ahelRELL2FCHSD1: 141 639 296–141 651 430, pöördne ahelFCHSD1ARAP3: 141 653 204–141 682 255, pöördne ahelARAP3PCDH1: 141 853 090–141 879 246, pöördne ahelPCDH1DELE1: 141 923 800–141 952 031, otsene ahelDELE1PCDH12: 141 943 581–141 969 741, pöördne ahelPCDH12RNF14: 141 958 305–142 003 016, otsene ahelRNF14GNPDA1: 141 991 749–142 013 061, pöördne ahelGNPDA1PCDHGC4 skeem: 4 eksonit kromosoomi 5 otsene ahelalEkson 1: 6 teadaolevat haigust põhjustavat kohtaEkson 1: 141 485 030–141 487 615, 2586 alustEkson 2: 141 494 807–141 494 865, 59 alustEkson 3: 141 505 393–141 505 481, 89 alustEkson 4: 141 510 947–141 512 975, 2029 alust12345′3′

Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.

Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).

Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.

Eksonid moodustavad geenist 4,8 kb kogupikkusega 27,9 kb; neist 2817 alust kodeerivad valku.

Kuidas genoomitest loetakse PCDHGC4

6

kohad geenis PCDHGC4, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks

Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.

Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni PCDHGC4 27,9 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (4,8 kb).

Geeniga PCDHGC4 seotud tunnused

Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida PCDHGC4 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.

Välised lingid

Kust see pärineb

  • HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
  • MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
  • ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
  • Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
  • Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.

Viita sellele lehele

APA

Dante Labs. (n.d.). PCDHGC4 geen: protocadherin gamma subfamily C, 4. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/pcdhgc4

Vancouver

Dante Labs. PCDHGC4 geen: protocadherin gamma subfamily C, 4 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/pcdhgc4

Üks test. Vastused kogu eluks.

Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast

Telli oma Genome Test