Geen
CLCN2
chloride voltage-gated channel 2
- HGNC 2020↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000114859↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1181↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 3q27.1
- Koordinaadid
- Kromosoom 3: 184 346 185–184 361 605 (GRCh38)
- Eksonid
- 24 eksonit, ulatus 15,4 kb
- Valk
- 898 aminohapet
- Tuntud ka kui
- CLC2, EJM6, ClC-2
- MANE Select transkript
- ENST00000265593.9NM_004366.6
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CLCN2 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Ostale pärilikud leukodüstroofiad
- Leukodüstroofia (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 80 sellega seotud geenist
Pärilikud seisundid, mis kahjustavad või takistavad müeliini, aju ja seljaaju valgeaine, normaalset moodustumist. Erinevad tüübid päranduvad autosoomselt retsessiivselt, autosoomselt dominantselt või X-seotult, sõltuvalt asjaomasest geenist.
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Konkreetse geneetilise põhjuse teadmine võib lõpetada diagnostilise otsingu, suunata toetavat ravi ja jälgimist, näidata, kas konkreetne ravi on olemas, ning võimaldada sugulaste testimist.
Kuidas CLCN2 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,2 kb kogupikkusega 15,4 kb; neist 2697 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CLCN2
20
kohad geenis CLCN2, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CLCN2 15,4 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,2 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Jagab 1 haigust
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialJagab 1 haigust
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 1 haigust
- ACER3alkaline ceramidase 3Jagab 1 haigust
- ADARadenosine deaminase RNA specificJagab 1 haigust
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Jagab 1 haigust
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Jagab 1 haigust
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Jagab 1 haigust
- ARSAarylsulfatase AJagab 1 haigust
- ASPAaspartoacylaseJagab 1 haigust
- ATP11AATPase phospholipid transporting 11AJagab 1 haigust
- CLDN11claudin 11Jagab 1 haigust
Geeniga CLCN2 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CLCN2 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CLCN2 geen: chloride voltage-gated channel 2. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/clcn2
Dante Labs. CLCN2 geen: chloride voltage-gated channel 2 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/clcn2
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast