Gen
MRE11
MRE11 double strand break repair nuclease
- HGNC 7230↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000020922↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 4361↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 11q21
- Souřadnice
- Chromozom 11: 94 415 570–94 493 844 (GRCh38)
- Exony
- 20 exonů na 78,3 kb
- Protein
- 708 aminokyselin
- Další názvy
- ATLD
- Předchozí symboly
- MRE11A
- Transkript MANE Select
- ENST00000323929.8NM_005591.4
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mre11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si MRE11 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
DNA Repair Disease
- Autozomálně recesivní
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- 4 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutozomálně dominantní
Jeden z 372 genů spojených s touto vazbou
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- 4 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
Jak je MRE11 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6,8 kb z 78,3 kb genu; 2 127 těchto bází kódují protein.
Sekvenování MRE11
1Snadné
Jak obtížné je sekvenovat MRE11 krátkými čteními, ze 100
0 · Snadné100 · Obtížné
Téměř všechny exony genu MRE11 leží v místech, kde se krátká čtení spolehlivě mapují.
Co k tomu přispívá: podíl exonů genu MRE11 v jednotlivých typech obtížných oblastí
- MapovatelnostÚseky, kde nelze čtení o délce 100 nebo 250 bp jednoznačně umístit, takže volání v nich může chybět nebo být chybné. Váha 35 %.0,8 %
- HomologieSegmentální duplikace: kopie jinde v genomu, například paralogy a pseudogeny, se shodou 90 % nebo více. Váha 30 %.0 %
- RepeticeTandemové repetice a úseky jedné báze, na kterých čtení sklouzávají a které nemusí přesně pokrýt. Váha 15 %.4,6 %
- Obsah GCOkna s méně než 25 % nebo více než 65 % G a C, která příprava knihovny pokrývá slabě. Váha 10 %.2,2 %
- Pokrytí referenčního genomuMezery v referenční sestavě v okolí, kde není sekvence, na kterou by se čtení mohla zarovnat. Váha 10 %.0 %
Skóre Dante Labs z vlastního výzkumu, založené na mapách obtížně sekvenovatelných oblastí Genome in a Bottle od NIST.Jak se skóre počítáKaždý sloupec udává podíl bází exonů genu MRE11 v daném typu obtížné oblasti. Jeden typ může gen sám o sobě učinit obtížným a každý další přidá méně: 0, pokud žádná báze není v žádném typu, 100, pokud je každá báze tam, kde nelze čtení jednoznačně umístit.
130
pozic v MRE11, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení obtížně zpracovávají.
Celý genom pokrývá všech 78,3 kb genu MRE11 včetně intronů, nejen 6,8 kb exonů.
ClinVar pathogenic variants (139)
The MRE11 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenní 56
- Patogenní/pravděpodobně patogenní 11
- Pravděpodobně patogenní 72
| Varianta | Conditions | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|
| NM_005591.4(MRE11):c.1897C>T (p.Arg633Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1714C>T (p.Arg572Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1516G>T (p.Glu506Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1960_1979dup (p.Lys661fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder 1 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1927-2A>G (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1867+2T>C (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1726C>T (p.Arg576Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1090C>T (p.Arg364Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1015A>T (p.Lys339Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.820_821del (p.Leu274fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.659+1G>A (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.630G>C (p.Trp210Cys) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder 1 | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.571C>T (p.Arg191Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.350A>G (p.Asn117Ser) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogenní/pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1927-1G>T (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1783+1G>A (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder 1 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1633_1640del (p.Leu545fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1603G>T (p.Glu535Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1458_1461del (p.Lys486fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1280dup (p.Leu427fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.784del (p.Tyr262fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.545-1G>A (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.314+4_314+7del (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Pravděpodobně patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_005591.4(MRE11):c.1979C>A (p.Ser660Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_005591.4(MRE11):c.1920T>A (p.Tyr640Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
See all 139 with every other MRE11 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Geny spojené se stejnými onemocněními
- APTXaprataxinSdílí 2 onemocnění
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Sdílí 2 onemocnění
- SETXsenataxinSdílí 2 onemocnění
- TDP1tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1Sdílí 2 onemocnění
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Sdílí 1 onemocnění
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialSdílí 1 onemocnění
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 7Sdílí 1 onemocnění
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Sdílí 1 onemocnění
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseSdílí 1 onemocnění
- ACER3alkaline ceramidase 3Sdílí 1 onemocnění
- ACO2aconitase 2Sdílí 1 onemocnění
- ADARadenosine deaminase RNA specificSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s MRE11
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit MRE11. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Dystonia
- Unsteady walk
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Chorea
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
Zobrazit ještě 13 rysů
- Delayed speech and language development
- Dilated fourth ventricle
- Diminished deep tendon reflex
- Enlarged interhemispheric fissure
- Inability to coordinate movements when walking
- Intention tremor
- Lack of coordination of movement
- Orofacial dyskinesia
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Jerking
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Decreased reflex response
Abnormality of the eye
- Oculomotor apraxia
- Horizontal jerk nystagmus
- Slow eye movements
- Abnormality of ocular smooth pursuit
- Gaze-evoked nystagmus
- Uncoordinated eye movement
- Vertical nystagmus
- Hypometric saccades
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-19: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Stratifikace genomu Genome in a Bottle od NIST: skóre obtížnosti sekvenování.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.19-9814e911.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen MRE11: MRE11 double strand break repair nuclease. Staženo 19. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/mre11
Dante Labs. Gen MRE11: MRE11 double strand break repair nuclease [Internet]. [citováno 19. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/mre11
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů