Gén
MRE11
MRE11 double strand break repair nuclease
- HGNC 7230↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000020922↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 4361↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 11q21
- Koordináták
- 11. kromoszóma: 94 415 570–94 493 844 (GRCh38)
- Exonok
- 20 exon, összesen 78,3 kb
- Fehérje
- 708 aminosav
- Más néven ismert
- ATLD
- Korábbi jelölések
- MRE11A
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000323929.8NM_005591.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mre11.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MRE11-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
DNA Repair Disease
- Autoszomális recesszív
A disease that has its basis in the disruption of DNA repair.
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutoszomális domináns
A 372 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
A MRE11 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 78,3 kb-jából 6,8 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2127 bázis kódolja a fehérjét.
MRE11 szekvenálása
3Könnyű
Mennyire nehéz a MRE11 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A MRE11 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a MRE11 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0,8%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.4,6%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.2,2%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a MRE11 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
130
a MRE11 azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a MRE11 mind a 78,3 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 6,8 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (139)
The MRE11 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 56
- Patogén/valószínűleg patogén 11
- Valószínűleg patogén 72
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_005591.4(MRE11):c.1897C>T (p.Arg633Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1714C>T (p.Arg572Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1516G>T (p.Glu506Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1960_1979dup (p.Lys661fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder 1 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1927-2A>G (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1867+2T>C (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1726C>T (p.Arg576Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1090C>T (p.Arg364Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1015A>T (p.Lys339Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.820_821del (p.Leu274fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.659+1G>A (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.630G>C (p.Trp210Cys) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder 1 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.571C>T (p.Arg191Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.350A>G (p.Asn117Ser) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1927-1G>T (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1783+1G>A (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder 1 | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1633_1640del (p.Leu545fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1603G>T (p.Glu535Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1458_1461del (p.Lys486fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1280dup (p.Leu427fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.784del (p.Tyr262fs) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.545-1G>A (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.314+4_314+7del (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder and 1 other | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_005591.4(MRE11):c.1979C>A (p.Ser660Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_005591.4(MRE11):c.1920T>A (p.Tyr640Ter) (opens in a new tab) | ataxia-telangiectasia-like disorder | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
See all 139 with every other MRE11 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- APTXaprataxin2 betegséget oszt meg
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 72 betegséget oszt meg
- SETXsenataxin2 betegséget oszt meg
- TDP1tyrosyl-DNA phosphodiesterase 12 betegséget oszt meg
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 betegséget oszt meg
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrial1 betegséget oszt meg
- ABCB7ATP binding cassette subfamily B member 71 betegséget oszt meg
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 11 betegséget oszt meg
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipase1 betegséget oszt meg
- ACER3alkaline ceramidase 31 betegséget oszt meg
- ACO2aconitase 21 betegséget oszt meg
- ADARadenosine deaminase RNA specific1 betegséget oszt meg
A(z) MRE11 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MRE11 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Difficulty articulating speech
- Dystonia
- Unsteady walk
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Chorea
- Choreoathetosis
- Degeneration of cerebellum
Még 13 tulajdonság megjelenítése
- Delayed speech and language development
- Dilated fourth ventricle
- Diminished deep tendon reflex
- Enlarged interhemispheric fissure
- Inability to coordinate movements when walking
- Intention tremor
- Lack of coordination of movement
- Orofacial dyskinesia
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Hyperactive deep tendon reflexes
- Jerking
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Decreased reflex response
Abnormality of the eye
- Oculomotor apraxia
- Horizontal jerk nystagmus
- Slow eye movements
- Abnormality of ocular smooth pursuit
- Gaze-evoked nystagmus
- Uncoordinated eye movement
- Vertical nystagmus
- Hypometric saccades
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MRE11 gén: MRE11 double strand break repair nuclease. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mre11
Dante Labs. MRE11 gén: MRE11 double strand break repair nuclease [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mre11
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt