Gen
IRF2BP2
interferon regulatory factor 2 binding protein 2
- HGNC 21729↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000168264↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 359948↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1q42.3
- Souřadnice
- Chromozom 1: 234 604 269–234 610 178 (GRCh38)
- Exony
- 2 exonů na 5,9 kb
- Protein
- 587 aminokyselin
- Další názvy
- LRIR2, IRF-2BP2
- Transkript MANE Select
- ENST00000366609.4NM_182972.3
- Typ lokusu
- Protein-coding
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/irf2bp2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si IRF2BP2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Common Variable Immunodeficiency (Monogenic CVID)
- Common variable immunodeficiency
Low IgG with low IgA and/or IgM and poor vaccine responses; single-gene forms include NFKB1, NFKB2, ICOS, CD19, CD81, CR2, IKZF1, IRF2BP2, SEC61A1 and TNFRSF13B (TACI).
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Immunoglobulin replacement and early treatment of infections are standard; a genetic cause can guide monitoring for autoimmunity, lymphoma and lung disease, and some forms (such as LRBA deficiency) respond to targeted therapy.
Širší skupiny
Other Inborn Errors of Immunity
- Inborn error of immunity
Jeden z 114 genů spojených s touto vazbou
Inherited disorders of the immune system caused by changes in single genes, affecting how the body fights infection or regulates inflammation.
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Immunodeficiency Disease
Jeden z 170 genů spojených s touto vazbou
Disease in which there is a deficiency or defect in the mechanisms of immunity, either cellular or humoral.
- 1 hodnotitel GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
HSCT for SCID and severe PIDs; immunoglobulin replacement (IVIG/SCIG) for antibody deficiencies; leniolisib (Joenja, FDA 2023) for APDS; gene therapy for ADA-SCID; abatacept for CTLA4/LRBA deficiency; prophylactic antibiotics; G-CSF for CGD
Jak je IRF2BP2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,3 kb z 5,9 kb genu; 1 764 těchto bází kódují protein.
Sekvenování IRF2BP2
4
pozic v IRF2BP2, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádná z nich nespadá do oblasti, kterou krátká čtení těžko zachytí.
Sekvenování celého genomu pokrývá všech 5,9 kb genu IRF2BP2, včetně intronů, nikoli jen 5,3 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CD19CD19 moleculeSdílí 3 onemocnění
- CR2complement C3d receptor 2Sdílí 3 onemocnění
- ICOSinducible T cell costimulatorSdílí 3 onemocnění
- IKZF1IKAROS family zinc finger 1Sdílí 3 onemocnění
- LRBALPS responsive beige-like anchor proteinSdílí 3 onemocnění
- NFKB1nuclear factor kappa B subunit 1Sdílí 3 onemocnění
- NFKB2nuclear factor kappa B subunit 2Sdílí 3 onemocnění
- SEC61A1SEC61 translocon subunit alpha 1Sdílí 3 onemocnění
- TNFRSF13BTNF receptor superfamily member 13BSdílí 3 onemocnění
- AICDAactivation induced cytidine deaminaseSdílí 2 onemocnění
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Sdílí 2 onemocnění
- BCL10BCL10 immune signaling adaptorSdílí 2 onemocnění
Rysy spojené s IRF2BP2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit IRF2BP2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen IRF2BP2: interferon regulatory factor 2 binding protein 2. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/irf2bp2
Dante Labs. Gen IRF2BP2: interferon regulatory factor 2 binding protein 2 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/irf2bp2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů