Gen
HSPD1
heat shock protein family D (Hsp60) member 1
- HGNC 5261↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000144381↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 3329↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2q33.1
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 197.486.584–197.499.840 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 13,3 kb
- Eiwit
- 573 aminozuren
- Ook bekend als
- GroEL, HSP60
- Eerdere symbolen
- SPG13
- MANE Select-transcript
- ENST00000388968.8NM_002156.5
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hspd1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees HSPD1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Erfelijke spastische paraplegie
- Erfelijke spastische paraplegie 13Autosomaal dominant
Elke erfelijke spastische paraplegie waarbij de oorzaak van de ziekte een mutatie in het HSPD1-gen is.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Hereditaire spastische paraplegie (alle typen)
Een van 66 genen die hiermee verband houden
Overkoepelende term voor alle hereditaire spastische paraplegieën, waaronder SPG4 (SPAST), de meest voorkomende dominante vorm, en SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 en SPG31.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Pelizaeus-Merzbacher-ziekte en hypomyeliniserende leukodystrofieën
- Pelizaeus-Merzbacher-achtige ziekte (GJC2 en andere)Autosomaal recessief
Een aandoening die sterk lijkt op de Pelizaeus-Merzbacher-ziekte en meestal wordt veroorzaakt door veranderingen in GJC2, met vroege nystagmus, vertraagde ontwikkeling en later spasticiteit.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Overige erfelijke leukodystrofieën
- Leukodystrofie (overige en niet-gespecificeerde typen)
Een van 80 genen die hiermee verband houden
Erfelijke aandoeningen die de vorming van myeline, de witte stof van de hersenen en het ruggenmerg, beschadigen of normale vorming verhinderen. Afhankelijk van het betrokken gen volgen de verschillende typen autosomaal recessieve, autosomaal dominante of X-gebonden overerving.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Het kennen van de specifieke genetische oorzaak kan een diagnostisch zoektraject beëindigen, de ondersteunende zorg en controles sturen, laten zien of een specifieke behandeling bestaat, en het mogelijk maken familieleden te testen.
Opbouw van HSPD1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,2 kb van de 13,3 kb van het gen; 1.722 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van HSPD1
4
posities in HSPD1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
1 daarvan (25%) valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
- Segmental duplications (1 locatie)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Een whole genome dekt alle 13,3 kb van HSPD1, inclusief intronen, en niet alleen de 2,2 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- GJC2gap junction protein gamma 2Deelt 3 aandoeningen
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deelt 2 aandoeningen
- AIMP1aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 1Deelt 2 aandoeningen
- PLP1proteolipid protein 1Deelt 2 aandoeningen
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Deelt 1 aandoening
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 1 aandoening
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDeelt 1 aandoening
- ACER3alkaline ceramidase 3Deelt 1 aandoening
- ADARadenosine deaminase RNA specificDeelt 1 aandoening
- AIMP2aminoacyl tRNA synthetase complex interacting multifunctional protein 2Deelt 1 aandoening
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Deelt 1 aandoening
- ALDH3A2aldehyde dehydrogenase 3 family member A2Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan HSPD1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die HSPD1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). HSPD1-gen: heat shock protein family D (Hsp60) member 1. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hspd1
Dante Labs. HSPD1-gen: heat shock protein family D (Hsp60) member 1 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hspd1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken