Gen
CLCN3
Cl-/H+ antiporter 3
- HGNC 2021↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000109572↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 1182↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 4q33
- Souřadnice
- Chromozom 4: 169 620 578–169 723 673 (GRCh38)
- Exony
- 13 exonů na 103,1 kb
- Protein
- 818 aminokyselin
- Další názvy
- CLC3, ClC-3
- Transkript MANE Select
- ENST00000513761.6NM_001829.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si CLCN3 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Zatím žádná zpráva Genome Test nečte gen CLCN3. Test sekvenuje celý váš genom, takže jsou vaše data přesto obsahují.
Jak je CLCN3 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 6,6 kb z 103,1 kb genu; 2 457 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte CLCN3
11
pozic v genu CLCN3, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 7 (64 %) leží v oblastech, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Segmental duplications (7 míst)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Celý genom pokrývá všech 103,1 kb genu CLCN3, včetně intronů, nikoli jen 6,6 kb exonů.
Rysy spojené s CLCN3
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit CLCN3. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal dentate nucleus morphology
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Delayed CNS myelination
- Delayed fine motor development
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
Zobrazit ještě 24 rysů
- Intellectual disability
- Lateral ventricle dilatation
- Myoclonic seizure
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Reduced amygdala volume
- Small hippocampus
- Thin corpus callosum
- Tonic seizure
- Anxiety
- Autism spectrum disorder
- Hypoplasia of the pons
- Restlessness
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Agenesis of corpus callosum
- Aqueductal stenosis
- Elongated superior cerebellar peduncle
- Frequent temper tantrums
- Grand mal seizures
- More active than typical
- Obsessive compulsive behavior
- Repetitive movements
- Small cerebellum
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Tented mouth
- Thin red part of the upper lip
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Almond shaped eyes
- Asymmetry of the posterior head
- Big calvaria
- Big lower jaw
Zobrazit ještě 22 rysů
- Broad head shape
- Bulbous nose
- Exaggerated cupid's bow
- Eye folds
- Frontal bossing
- Full cheeks
- High frontal hairline
- High palate
- Little lower jaw
- Long face
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Low hanging columella
- Midface retrusion
- Monobrow
- Narrow mouth
- Narrow nasal ridge
- Prominent forehead
- Prominent metopic ridge
- Short philtrum
- Thick eyebrow
- Wide fontanelles
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Retinal pigment epithelial mottling
- Visual fixation instability
- Cross-eyed
- Abnormally close eyes
- Anisometropia
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Drooping of both upper eyelids
Zobrazit ještě 4 rysů
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen CLCN3: Cl-/H+ antiporter 3. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/clcn3
Dante Labs. Gen CLCN3: Cl-/H+ antiporter 3 [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/clcn3
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů