Gene
CLCN3
Cl-/H+ antiporter 3
- HGNC 2021↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000109572↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 1182↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 4q33
- Coordinate
- Cromosoma 4: 169.620.578–169.723.673 (GRCh38)
- Esoni
- 13 esoni su 103,1 kb
- Proteina
- 818 amminoacidi
- Noto anche come
- CLC3, ClC-3
- Trascritto MANE Select
- ENST00000513761.6NM_001829.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Nessun report del Genome Test legge ancora CLCN3. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.
Struttura di CLCN3
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 6,6 kb dei 103,1 kb del gene; 2457 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge CLCN3
11
posizioni in CLCN3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
7 di esse (64%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.
- Segmental duplications (7 siti)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Un genoma intero copre tutti i 103,1 kb di CLCN3, introni inclusi, non solo i 6,6 kb di esoni.
Tratti collegati a CLCN3
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che CLCN3 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal dentate nucleus morphology
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Delayed CNS myelination
- Delayed fine motor development
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
Mostra altri 24 tratti
- Intellectual disability
- Lateral ventricle dilatation
- Myoclonic seizure
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Reduced amygdala volume
- Small hippocampus
- Thin corpus callosum
- Tonic seizure
- Anxiety
- Autism spectrum disorder
- Hypoplasia of the pons
- Restlessness
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Agenesis of corpus callosum
- Aqueductal stenosis
- Elongated superior cerebellar peduncle
- Frequent temper tantrums
- Grand mal seizures
- More active than typical
- Obsessive compulsive behavior
- Repetitive movements
- Small cerebellum
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Tented mouth
- Thin red part of the upper lip
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Almond shaped eyes
- Asymmetry of the posterior head
- Big calvaria
- Big lower jaw
Mostra altri 22 tratti
- Broad head shape
- Bulbous nose
- Exaggerated cupid's bow
- Eye folds
- Frontal bossing
- Full cheeks
- High frontal hairline
- High palate
- Little lower jaw
- Long face
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Low hanging columella
- Midface retrusion
- Monobrow
- Narrow mouth
- Narrow nasal ridge
- Prominent forehead
- Prominent metopic ridge
- Short philtrum
- Thick eyebrow
- Wide fontanelles
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Retinal pigment epithelial mottling
- Visual fixation instability
- Cross-eyed
- Abnormally close eyes
- Anisometropia
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Drooping of both upper eyelids
Mostra altri 4 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene CLCN3: Cl-/H+ antiporter 3. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/clcn3
Dante Labs. Gene CLCN3: Cl-/H+ antiporter 3 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/clcn3
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