Gén
CLCN3
Cl-/H+ antiporter 3
- HGNC 2021↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000109572↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 1182↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 4q33
- Koordináták
- 4. kromoszóma: 169 620 578–169 723 673 (GRCh38)
- Exonok
- 13 exon, összesen 103,1 kb
- Fehérje
- 818 aminosav
- Más néven ismert
- CLC3, ClC-3
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000513761.6NM_001829.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/clcn3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a CLCN3-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) CLCN3 gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.
A CLCN3 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 103,1 kb-jából 6,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2457 bázis kódolja a fehérjét.
CLCN3 szekvenálása
11
CLCN3-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül 7 (64%) olyan régiókba esnek, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
- Segmental duplications (7 pozíció)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
A teljes genomszekvenálás a CLCN3 gén mind a 103,1 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 6,6 kb-át.
A(z) CLCN3 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) CLCN3 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal dentate nucleus morphology
- Absent speech development
- Delayed ability to walk
- Delayed CNS myelination
- Delayed fine motor development
- Delayed motor skills
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
Még 24 tulajdonság megjelenítése
- Intellectual disability
- Lateral ventricle dilatation
- Myoclonic seizure
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Reduced amygdala volume
- Small hippocampus
- Thin corpus callosum
- Tonic seizure
- Anxiety
- Autism spectrum disorder
- Hypoplasia of the pons
- Restlessness
- Seizure affecting one half of brain
- Self-injurious behavior
- Agenesis of corpus callosum
- Aqueductal stenosis
- Elongated superior cerebellar peduncle
- Frequent temper tantrums
- Grand mal seizures
- More active than typical
- Obsessive compulsive behavior
- Repetitive movements
- Small cerebellum
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Tented mouth
- Thin red part of the upper lip
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Almond shaped eyes
- Asymmetry of the posterior head
- Big calvaria
- Big lower jaw
Még 22 tulajdonság megjelenítése
- Broad head shape
- Bulbous nose
- Exaggerated cupid's bow
- Eye folds
- Frontal bossing
- Full cheeks
- High frontal hairline
- High palate
- Little lower jaw
- Long face
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Low hanging columella
- Midface retrusion
- Monobrow
- Narrow mouth
- Narrow nasal ridge
- Prominent forehead
- Prominent metopic ridge
- Short philtrum
- Thick eyebrow
- Wide fontanelles
Abnormality of the eye
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Retinal pigment epithelial mottling
- Visual fixation instability
- Cross-eyed
- Abnormally close eyes
- Anisometropia
- Breakdown of light-sensitive cells in back of eye
- Drooping of both upper eyelids
Még 4 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). CLCN3 gén: Cl-/H+ antiporter 3. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/clcn3
Dante Labs. CLCN3 gén: Cl-/H+ antiporter 3 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/clcn3
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt