Gen
SOX5
SRY-box transcription factor 5
- HGNC 11201↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000134532↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 6660↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 12p12.1
- Koordinatlar
- Kromozom 12: 23.529.504–23.949.670 (GRCh38)
- Eksonlar
- 420,2 kb boyunca 15 ekson
- Protein
- 763 amino asit
- Diğer adları
- L-SOX5, MGC35153
- MANE Select transkripti
- ENST00000451604.7NM_006940.6
- Lokus türü
- Protein-coding
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Bu sayfanın veri olarak görünümü
Veriyi JSON olarak okumak için sayfa adresinin sonuna .json ekleyin veya application/json isteyin.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/sox5.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameSOX5 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Lamb-Shaffer Sendromu
- Otozomal dominant
SOX5'in işlevsel bir kopyasının kaybıyla ortaya çıkan bir bozukluktur. Bu kayıp, genin tamamını ya da bir bölümünü kaldıran 12p12 delesyonu veya gen içindeki bir dizi varyantı yoluyla oluşur. Vakaların çoğu de novo gelişir.
- ClinGen bu ilişkiyi kesin olarak değerlendiriyor
- 4 GenCC gönderici kurum bunu kesin veya güçlü olarak değerlendiriyor
▶Eyleme geçirilebilirlik
Gelişimsel, konuşma ve eğitimsel destek ile göz, omurga ve davranışsal değerlendirme gerekir; nöbetler görüldüğünde genellikle tedaviye iyi yanıt verir. Vakaların çoğu de novo gelişir, ancak ebeveynlerden biri değişikliği taşıyor olabilir; bazen yalnızca bazı hücrelerinde. Bu nedenle, varyant yeni görünse bile tekrarlama riskini belirlemede genetik danışmanlık ve ebeveyn testleri yol gösterici olur.
SOX5 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 420,2 kb uzunluğunun 7,1 kb'sini oluşturur; bu bazların 2.292 tanesi proteini kodlar.
SOX5 dizilemesi
52
ClinVar'ın patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı SOX5 içindeki konumlar
Bunların hiçbiri kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom, intronlar dahil, SOX5 genindeki tüm 420,2 kb'yi kapsar; yalnızca 7,1 kb'lik ekzonları değil.
SOX5 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, SOX5 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of head or neck
- Big maxilla
- Deep central lingual groove
- Dental crowding
- Frontal bossing
- Narrow palate
- Bulbous nose
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
4 özellik daha göster
Abnormality of the integument
- Abnormal skin pigmentation
- Giant pigmented mole
- Mole
- Dry skin
- Lack of sweating
- Poor wound healing
- Cutaneous melanoma
- Excessive hair growth
3 özellik daha göster
Abnormality of the musculoskeletal system
- Excessive inward curvature of lower spine
- Low muscle tone
- Pigeon chest
- Thoracic kyphoscoliosis
- Vertebral fusion
- Butterfly vertebrae
- Scoliosis
- Vertebral clefting
2 özellik daha göster
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-17 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.17-8666dff2.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). SOX5 geni: SRY-box transcription factor 5. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/sox5
Dante Labs. SOX5 geni: SRY-box transcription factor 5 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/sox5
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde