Gene
SOX5
SRY-box transcription factor 5
- HGNC 11201↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000134532↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 6660↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 12p12.1
- Coordinate
- Cromosoma 12: 23.529.504–23.949.670 (GRCh38)
- Esoni
- 15 esoni su 420,2 kb
- Proteina
- 763 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Noto anche come
- L-SOX5, MGC35153
- Trascritto MANE Select
- ENST00000451604.7NM_006940.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
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Sindrome di Lamb-Shaffer
- Autosomica dominante
Un disturbo causato dalla perdita di una copia funzionante di SOX5, dovuta a una delezione 12p12 che rimuove tutto o parte del gene oppure a una variante di sequenza al suo interno. La maggior parte dei casi insorge de novo.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Supporto nello sviluppo, nel linguaggio e nell'istruzione, con valutazione oculistica, della colonna vertebrale e comportamentale; le crisi convulsive, quando si verificano, di solito rispondono bene al trattamento. La maggior parte dei casi insorge de novo, ma un genitore può essere portatore della variante, a volte solo in alcune delle sue cellule; pertanto la consulenza genetica e il test dei genitori orientano il rischio di ricorrenza anche quando una variante appare nuova.
Ereditarietà
- Autosomica dominante
- Basta una copia modificata, proveniente da uno dei genitori. Un genitore che ne è portatore la trasmette a ciascun figlio con una probabilità su due.
Struttura di SOX5
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 7,1 kb dei 420,2 kb del gene; 2292 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge SOX5
52
posizioni in SOX5 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 420,2 kb di SOX5, introni inclusi, non solo i 7,1 kb di esoni.
Tratti collegati a SOX5
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che SOX5 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of head or neck
- Big maxilla
- Deep central lingual groove
- Dental crowding
- Frontal bossing
- Narrow palate
- Bulbous nose
- Depressed nasal bridge
- Downward slanting of the opening between the eyelids
Mostra altri 4 tratti
Abnormality of the integument
- Abnormal skin pigmentation
- Giant pigmented mole
- Mole
- Dry skin
- Lack of sweating
- Poor wound healing
- Cutaneous melanoma
- Excessive hair growth
Mostra altri 3 tratti
Abnormality of the musculoskeletal system
- Excessive inward curvature of lower spine
- Low muscle tone
- Pigeon chest
- Thoracic kyphoscoliosis
- Vertebral fusion
- Butterfly vertebrae
- Scoliosis
- Vertebral clefting
Mostra altri 2 tratti
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
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Dante Labs. (s.d.). Gene SOX5: SRY-box transcription factor 5. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/sox5
Dante Labs. Gene SOX5: SRY-box transcription factor 5 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/sox5
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