Gen
SLC39A14
solute carrier family 39 member 14
- HGNC 20858↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000104635↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 23516↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 8p21.3
- Koordinater
- Kromosom 8: 22 367 278–22 422 736 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner på 55,5 kb
- Protein
- 492 aminosyror
- Även känd som
- KIAA0062, NET34, ZIP14, ZIP-14
- MANE Select-transkript
- ENST00000381237.6NM_001128431.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc39a14.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs SLC39A14, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Ärftliga störningar i mangantransportörer
- Hypermanganemi med dystoniAutosomalt recessiv
Ansamling av mangan i hjärnan och andra organ orsakad av varianter i SLC30A10 eller SLC39A14, vilket leder till progressiv dystoni och parkinsonism och, vid SLC30A10, leversjukdom och polycytemi.
- 3 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Genom att veta om detta kan du få tidig behandling med kelatbildande terapi och järntillskott, vilket kan sänka manganhalterna och kan förbättra eller stabilisera symtomen.
Så är SLC39A14 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 4,7 kb av genens 55,5 kb, och 1 479 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av SLC39A14
1Låg
Hur svår SLC39A14 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av SLC39A14s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.1,6 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.5,4 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
6
positioner i SLC39A14 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 55,5 kb av SLC39A14, inklusive introner, inte bara de 4,7 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till SLC39A14
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som SLC39A14 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Dystonia
- Hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Inability to walk
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Bulbar signs
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
Visa ytterligare 22 egenskaper
- Disorder of involuntary muscle movements
- Generalized dystonia
- Global developmental delay
- Headache
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Irritability
- Limb dystonia
- Loss of ability to walk
- Loss of developmental milestones
- Oromandibular dystonia
- Parkinsonism
- Poor speech
- Slow movements
- Toe walking
- Tremor
- Absent speech development
- Brisk reflexes
- Chiari type I malformation
- Clumsiness
- Decreased muscle movement
- Worsening neurological symptoms
Abnormality of head or neck
- Chewing difficulties
- Osteosclerosis of the base of the skull
- Overgrowth of skullcap
- Bell's palsy
- Decreased facial expressions
- Development of small head that was not present at birth
- Lost smell
- Progressively abnormally small cranium
Visa ytterligare 5 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). SLC39A14-genen: solute carrier family 39 member 14. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/slc39a14
Dante Labs. SLC39A14-genen: solute carrier family 39 member 14 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/slc39a14
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor