Gen
NOP56
NOP56 ribonucleoprotein
- HGNC 15911↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000101361↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 10528↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 20p13
- Koordinater
- Kromosom 20: 2 652 632–2 658 393 (GRCh38)
- Exoner
- 12 exoner på 5,8 kb
- Protein
- 594 aminosyror, 66,1 kDa
- Även känd som
- SCA36
- Tidigare symboler
- NOL5A
- MANE Select-transkript
- ENST00000329276.10NM_006392.4
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Share this page
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/nop56.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs NOP56, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Autosomala dominanta cerebellära ataxier (SCA och DRPLA)
- Autosomal dominant cerebellär ataxiAutosomalt dominant
En grupp dominant ärftliga ataxier, inklusive SCA1, SCA2, SCA3 (Machado-Josephs sjukdom), SCA6, SCA7, SCA17, SCA27B och DRPLA, orsakade av repetitionsexpansioner eller punktvarianter i gener som ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, TBP, ATN1 och FGF14.
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Genetisk rådgivning och presymptomatisk testning för släktingar, sjukgymnastik och symtomlindring; vissa former, till exempel SCA27B, kan svara på specifik medicinering.
Bredare grupperingar
Ärftliga neurodegenerativa sjukdomar
- KIF5A-relaterad neurodegenerativ sjukdomAutosomalt dominant
En av 372 gener kopplade till den
Orsakas av förändringar i en kopia av KIF5A, som kodar för ett motorprotein med en svans som binder lastmolekyler. Olika typer av förändringar leder till olika tillstånd: hereditär spastisk paraplegi typ 10, en axonal form av Charcot-Marie-Tooths sjukdom och amyotrofisk lateralskleros (ALS).
- 2 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Vården är symtomlindrande och beror på hur sjukdomen visar sig, och omfattar bland annat sjukgymnastik, läkemedel mot spasticitet och multidisciplinär ALS-vård. Varje barn till en drabbad person har 1 av 2 chans att ärva förändringen; genetisk rådgivning hjälper familjer att förstå detta.
Så är NOP56 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 1,9 kb av genens 5,8 kb, och 1 785 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av NOP56
6Lätt
Hur svår NOP56 är att sekvensera med korta läsningar, av 100
0 · Lätt100 · Svår
Nästan alla exoner i NOP56 ligger där korta läsningar kartläggs tydligt.
Det som tillkommer: andelen av NOP56s exoner i varje typ av svår region
- KartläggbarhetSträckor där 100 eller 250 bp långa läsningar inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 100.5,3 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- Delas med chrYDe pseudoautosomala regionerna och den X-transponerade regionen, där chrX och chrY bär samma eller nästan samma sekvens, så en läsning från den ena kan placeras på den andra. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 60.0 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassemblyn, där det inte finns någon sekvens för läsningarna att anpassas mot. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 50.0 %
- RepetitionerTandemrepetitioner och serier av en och samma bas, där läsningar glider och som kanske inte spänns över. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 30.0 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksberedningen täcker glest. Ensam skulle en gen som helt ligger i denna typ av region få 20.6,4 %
Ett Dante Labs-poäng från egen forskning, baserat på NIST:s Genome in a Bottle-kartor över svårsekvenserade regioner.Så poängsätts detVarje stapel är andelen av NOP56s exonbaser i den typen av svår region. Varje enskild typ kan göra en gen svår på egen hand, och varje ytterligare typ lägger till mindre: 0 när ingen bas ligger i någon, 100 när varje bas ligger där läsningar inte kan placeras entydigt.
Gener kopplade till samma tillstånd
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Delar 2 tillstånd
- ATN1atrophin 1Delar 2 tillstånd
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Delar 2 tillstånd
- ATXN1ataxin 1Delar 2 tillstånd
- ATXN10ataxin 10Delar 2 tillstånd
- ATXN2ataxin 2Delar 2 tillstånd
- ATXN3ataxin 3Delar 2 tillstånd
- ATXN7ataxin 7Delar 2 tillstånd
- BEAN1brain expressed associated with NEDD4 1Delar 2 tillstånd
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADelar 2 tillstånd
- CACNA1Gcalcium voltage-gated channel subunit alpha1 GDelar 2 tillstånd
- CAMTA1calmodulin binding transcription activator 1Delar 2 tillstånd
Egenskaper kopplade till NOP56
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NOP56 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-21: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.21-311f020e.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). NOP56-genen: NOP56 ribonucleoprotein. Hämtad 21 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nop56
Dante Labs. NOP56-genen: NOP56 ribonucleoprotein [Internet]. [citerad 21 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nop56
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor