Genă
CWF19L1
CWF19 like cell cycle control factor 1
- HGNC 25613↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000095485↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 55280↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 10q24.31
- Coordonate
- Cromozomul 10: 100.232.298–100.267.638 (GRCh38)
- Exoni
- 14 de exoni pe 35,3 kb
- Proteină
- 538 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- C19L1, FLJ10998, hDrn1
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000354105.10NM_018294.6
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/cwf19l1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți CWF19L1 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Ataxii cerebeloase autosomal recesive (inclusiv CANVAS și AVED)
- Ataxie cerebeloasă autosomal recesivăAutozomal recesivă
Una dintre cele 57 gene legate de ea
Un grup de ataxii cu transmitere recesivă, cauzate de variante bialelice în gene precum RFC1, FXN, SACS, TTPA, SETX, APTX, PNKP, ANO10 și SYNE1.
- ClinGen evaluează legătura ca definitivă
- 3 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Ataxia cu deficit de vitamina E (TTPA) poate fi tratată cu suplimente de vitamina E; celelalte forme sunt gestionate prin kinetoterapie și îngrijire simptomatică, iar rudelor pot fi oferite teste de purtător.
Structura genei CWF19L1
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 2,6 kb din cei 35,3 kb ai genei; 1.617 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea CWF19L1
1Scăzut
Cât de greu este de secvențiat CWF19L1 cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale CWF19L1 aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.3,6 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.1,9 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
19
poziții în CWF19L1 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un genom întreg acoperă toți cei 35,3 kb ai lui CWF19L1, inclusiv intronii, nu doar cei 2,6 kb de exoni.
Gene asociate acelorași afecțiuni
- AHI1Abelson helper integration site 1Are 1 afecțiune în comun
- ANO10anoctamin 10Are 1 afecțiune în comun
- ATCAYATCAY kinesin light chain interacting caytaxinAre 1 afecțiune în comun
- ATG7autophagy related 7Are 1 afecțiune în comun
- ATP8A2ATPase phospholipid transporting 8A2Are 1 afecțiune în comun
- CA8carbonic anhydrase 8 (inactive)Are 1 afecțiune în comun
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2AAre 1 afecțiune în comun
- CEP290centrosomal protein 290Are 1 afecțiune în comun
- CEP41centrosomal protein 41Are 1 afecțiune în comun
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Are 1 afecțiune în comun
- COQ8Acoenzyme Q8AAre 1 afecțiune în comun
- CSPP1centrosome and spindle pole associated protein 1Are 1 afecțiune în comun
Trăsături asociate cu CWF19L1
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca CWF19L1. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Clumsiness
- Degeneration of cerebellum
- Delayed speech and language development
- Difficulty articulating speech
- Dystonia
- Global developmental delay
Afișați încă 17 de trăsături
- Inability to coordinate movements when walking
- Increased reflexes
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Intention tremor
- Lack of coordination of movement
- Limb ataxia
- Small cerebellum
- Unsteady walk
- Wide based walk
- Babinski sign
- IQ between 34 and 49
- Monotonic speech
- Nonprogressive cerebellar ataxia
- Slurred speech
- Agenesis of corpus callosum
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-17: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.17-8666dff2.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena CWF19L1: CWF19 like cell cycle control factor 1. Accesat 17 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/cwf19l1
Dante Labs. Gena CWF19L1: CWF19 like cell cycle control factor 1 [Internet]. [citat 17 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/cwf19l1
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni