Gen
PGAP3
post-GPI attachment to proteins phospholipase 3
- HGNC 23719↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000161395↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 93210↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 17q12
- Coördinaten
- Chromosoom 17: 39.671.122–39.688.057 (GRCh38)
- Exons
- 8 exons over 16,9 kb
- Eiwit
- 320 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal recessief
- Ook bekend als
- MGC9753, CAB2, PP1498, PER1
- Eerdere symbolen
- PERLD1
- MANE Select-transcript
- ENST00000300658.9NM_033419.5
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees PGAP3 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Defecten in de biosynthese van het GPI-anker
- Hyperfosfatasie met verstoorde intellectuele ontwikkeling (Mabry-syndroom)Autosomaal recessief
Een groep defecten in het GPI-anker (PIGV, PIGO, PGAP2, PGAP3, PIGW, PIGY) waarbij een aanhoudend verhoogd alkalisch fosfatase samengaat met ontwikkelingsvertraging, epileptische aanvallen en korte eindkootjes van de vingers.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Wat weten verandert
Bij sommige getroffen kinderen is de aanvalscontrole verbeterd met pyridoxine (vitamine B6). Een diagnose kan daarom een gerichte proefbehandeling door een specialist sturen.
- Stoornissen in de biosynthese van het GPI-anker
Een groep erfelijke aandoeningen veroorzaakt door varianten in de PIG-, PGAP- en verwante genen die nodig zijn om het GPI-anker aan te maken en te hechten. Meestal leiden ze tot ontwikkelingsvertraging, een lage spierspanning en epilepsie.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Bredere groeperingen
Congenitale glycosylatiestoornissen
- Congenitale glycosylatiestoornissen (CDG)
Een van 98 genen die hiermee verband houden
Een grote groep erfelijke aandoeningen waarbij suikerketens (glycanen) niet correct worden opgebouwd of aan eiwitten en lipiden worden gehecht, wat vaak gevolgen heeft voor de hersenen, de lever, de bloedstolling, de groei en veel andere lichaamssystemen. De meeste zijn autosomaal recessief, maar sommige zijn X-gebonden of autosomaal dominant.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Overerving
- Autosomaal recessief
- Er is een veranderde kopie van elke ouder nodig. Met één bent u drager en meestal niet aangedaan. Wanneer beide ouders dragers zijn, heeft elk kind een kans van één op vier om er twee te erven.
Opbouw van PGAP3
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,7 kb van de 16,9 kb van het gen; 963 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest PGAP3 leest
27
posities in PGAP3 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 16,9 kb van PGAP3, inclusief introns, en niet alleen de 2,7 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- PGAP2post-GPI attachment to proteins 2Deelt 3 aandoeningen
- PIGOphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class ODeelt 3 aandoeningen
- PIGVphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class VDeelt 3 aandoeningen
- PIGWphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class WDeelt 3 aandoeningen
- PIGYphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class YDeelt 3 aandoeningen
- PIGAphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class ADeelt 2 aandoeningen
- PIGGphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class G (EMM blood group)Deelt 2 aandoeningen
- PIGLphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class LDeelt 2 aandoeningen
- PIGNphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class NDeelt 2 aandoeningen
- PIGTphosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class TDeelt 2 aandoeningen
- ST3GAL5ST3 beta-galactoside alpha-2,3-sialyltransferase 5Deelt 2 aandoeningen
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan PGAP3
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die PGAP3 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Broad nasal tip
- Short nose
- Tented mouth
- Wide nasal bridge
- Abnormal facial shape
- Abnormally small head
- Broad opening between the eyelids
- Cleft palate
Toon 21 kenmerken meer
- Downturned corners of mouth
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Abnormal parietal bone morphology
- Asymmetry of the posterior head
- Bifid uvula
- Big lower jaw
- Broad head shape
- Broad philtrum
- Bulbous nose
- Coarse facial features
- Decreased head circumference
- Eye folds
- High palate
- Highly arched eyebrow
- Increased head circumference
- Little lower jaw
- Prominent nasal bridge
- Round face
- Short neck
- Short philtrum
- Thin red part of the upper lip
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Delayed motor skills
- Global developmental delay
- Epilepsy
- Inability to walk
- Grand mal seizures
- Intellectual disability
- Involuntary movements
Toon 14 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). PGAP3-gen: post-GPI attachment to proteins phospholipase 3. Geraadpleegd op 16 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/pgap3
Dante Labs. PGAP3-gen: post-GPI attachment to proteins phospholipase 3 [Internet]. [geraadpleegd 16 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/pgap3
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken