Gen
CHRNE
cholinergic receptor nicotinic epsilon subunit
- HGNC 1966↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000108556↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 1145↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 17p13.2
- Coördinaten
- Chromosoom 17: 4.897.771–4.903.098 (GRCh38)
- Exons
- 12 exons over 5,3 kb
- Eiwit
- 493 aminozuren
- Ook bekend als
- ACHRE
- MANE Select-transcript
- ENST00000649488.2NM_000080.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/chrne.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees CHRNE en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Congenitale myasthene syndromen
- Congenitale myasthene syndromen 4Autosomaal recessief
Elk postsynaptisch congenitaal myasthene syndroom waarbij de oorzaak van de ziekte een mutatie in het CHRNE-gen is.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Congenitaal myasthenisch syndroom (alle typen)
Overkoepelende term voor alle congenitale myasthene syndromen, waaronder de veelvoorkomende vormen met CHRNE, RAPSN, DOK7 en MUSK.
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Veel vormen reageren op specifieke medicijnen, zoals pyridostigmine, salbutamol of efedrine, en welke keuze geschikt is, hangt af van het betrokken gen.
Opbouw van CHRNE
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2,5 kb van de 5,3 kb van het gen; 1.482 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing CHRNE
254
posities in CHRNE waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een regio die korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 5,3 kb van CHRNE, inclusief intronen, en niet alleen de 2,5 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (298)
The CHRNE variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 146
- Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen 46
- Waarschijnlijk pathogeen 106
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_000080.4(CHRNE):c.1364ACA[1] (p.Asn456del) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1353dup (p.Asn452fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1327del (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 4 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1319_1326+15del (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1252_1267dup (p.Cys423fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome 4A and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1251_1266dup (p.Cys423fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1255G>T (p.Glu419Ter) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome 4A and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1220-8_1227dup (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1216_1219+19del (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1219+2T>G (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1204C>T (p.Gln402Ter) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1181_1187dup (p.Glu396delinsAspValTer) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1158dup (p.Lys387fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome 4A | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1116_1128del (p.Ser373fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1093del (p.Ala365fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1072_1091del (p.Pro358fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1090dup (p.Arg364fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1062_1081dup (p.Glu361fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome 4A and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1033-1G>C (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.1002_1008dup (p.Ala337fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.992G>A (p.Arg331Gln) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.988C>T (p.Gln330Ter) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.971del (p.Ile324fs) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 3 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.918-1G>A (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_000080.4(CHRNE):c.850A>C (p.Thr284Pro) (opens in a new tab) | congenital myasthenic syndrome 4A | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
See all 298 with every other CHRNE variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- AGRNagrinDeelt 1 aandoening
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeelt 1 aandoening
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- CHATcholine O-acetyltransferaseDeelt 1 aandoening
- CHRNA1cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunitDeelt 1 aandoening
- CHRNB1cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunitDeelt 1 aandoening
- CHRNDcholinergic receptor nicotinic delta subunitDeelt 1 aandoening
- COL13A1collagen type XIII alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COLQcollagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesteraseDeelt 1 aandoening
- DOK7docking protein 7Deelt 1 aandoening
- DPAGT1dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1Deelt 1 aandoening
- GFPT1glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan CHRNE
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die CHRNE kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the musculoskeletal system
- EMG: decremental response of compound muscle action potential to repetitive nerve stimulation
- Fatigable weakness
- Fatigable weakness of skeletal muscles
- Arthrogryposis multiplex congenita
- Bulbar palsy
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
- Decreased muscle mass
- Generalized decreased muscle tone
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-18: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.18-8b139e39.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). CHRNE-gen: cholinergic receptor nicotinic epsilon subunit. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/chrne
Dante Labs. CHRNE-gen: cholinergic receptor nicotinic epsilon subunit [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/chrne
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken