Gen
AGRN
agrin
- HGNC 329↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000188157↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 375790↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1p36.33
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 1.020.120–1.056.116 (GRCh38)
- Exons
- 36 exons over 36 kb
- Eiwit
- 2.045 aminozuren
- Eerdere symbolen
- AGRIN
- MANE Select-transcript
- ENST00000379370.7NM_198576.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/agrn.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees AGRN en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Congenitale myasthene syndromen
- Congenitale myasthene syndromen 8Autosomaal recessief
Elk congenitaal myasthene syndroom waarbij de oorzaak van de ziekte een mutatie in het AGRN-gen is.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Congenitaal myasthenisch syndroom (alle typen)
Overkoepelende term voor alle congenitale myasthene syndromen, waaronder de veelvoorkomende vormen met CHRNE, RAPSN, DOK7 en MUSK.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Veel vormen reageren op specifieke medicijnen, zoals pyridostigmine, salbutamol of efedrine, en welke keuze geschikt is, hangt af van het betrokken gen.
Opbouw van AGRN
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7,3 kb van de 36 kb van het gen; 6.138 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van AGRN
55
posities in AGRN waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 36 kb van AGRN, inclusief intronen, en niet alleen de 7,3 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitDeelt 1 aandoening
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseDeelt 1 aandoening
- CHATcholine O-acetyltransferaseDeelt 1 aandoening
- CHRNA1cholinergic receptor nicotinic alpha 1 subunitDeelt 1 aandoening
- CHRNB1cholinergic receptor nicotinic beta 1 subunitDeelt 1 aandoening
- CHRNDcholinergic receptor nicotinic delta subunitDeelt 1 aandoening
- CHRNEcholinergic receptor nicotinic epsilon subunitDeelt 1 aandoening
- COL13A1collagen type XIII alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COLQcollagen like tail subunit of asymmetric acetylcholinesteraseDeelt 1 aandoening
- DOK7docking protein 7Deelt 1 aandoening
- DPAGT1dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase 1Deelt 1 aandoening
- GFPT1glutamine--fructose-6-phosphate transaminase 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan AGRN
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die AGRN kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). AGRN-gen: agrin. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/agrn
Dante Labs. AGRN-gen: agrin [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/agrn
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken